137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0857 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 172 aa  345  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  57.06 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  44 
 
 		 220 aa  147  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  36.02 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  35.48 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  37.84 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  35.68 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  34.83 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  34.07 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  27.96 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  35.75 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  30.16 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  31.44 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  27.81 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  31.69 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  29.28 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  27.66 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  30.21 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  30.34 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0760  2'-5' RNA ligase  32.77 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  26.03 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  35.56 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  24.18 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  30.34 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  24.19 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  31.35 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  32.63 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  31.29 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  28.88 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  27.41 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  23.76 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  28.38 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  27.78 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1029  2'-5' RNA ligase  31.09 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  28.34 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  30.32 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  22.65 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  26.35 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  28.4 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  27.61 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  27.57 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1946  2',5' RNA ligase  27.93 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  28.72 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  20.34 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  37.76 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  30.65 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  28.19 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  25.7 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  25.84 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  28.12 
 
 		 193 aa  51.2  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 194 aa  51.2  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.15 
 
 		 184 aa  50.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0487  2'-5' RNA ligase  24.43 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  35.76 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  32.26 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  27.33 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  29.44 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  31.21 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2498  2'-5' RNA ligase  25.98 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  31.67 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  29.01 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  35.76 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  35.76 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  27.54 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  23.97 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  31.33 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  31.71 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  31.38 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  31.06 
 
 		 183 aa  47.8  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  32.87 
 
 		 188 aa  47.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  27.33 
 
 		 202 aa  47.8  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  27.21 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  32.9 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  31.62 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  26.34 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3075  2'-5' RNA ligase  30.06 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  26.4 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  31.84 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  32.37 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  30.15 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  30.1 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  29.7 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>