More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3529 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  100 
 
 
149 aa  302  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  60 
 
 
151 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  52.7 
 
 
150 aa  159  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  54 
 
 
150 aa  157  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  50.67 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  48.32 
 
 
150 aa  143  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  46.15 
 
 
157 aa  142  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  52.55 
 
 
141 aa  140  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  43.15 
 
 
164 aa  137  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  48.99 
 
 
148 aa  135  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  45.39 
 
 
145 aa  122  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  46.81 
 
 
145 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  46.48 
 
 
145 aa  121  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  46.1 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  41.18 
 
 
165 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  44.14 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  47.5 
 
 
120 aa  114  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  43.26 
 
 
180 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  43.85 
 
 
130 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  42.45 
 
 
144 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  42.96 
 
 
159 aa  105  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  41.84 
 
 
152 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  41.84 
 
 
148 aa  104  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  40.97 
 
 
152 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  40.26 
 
 
156 aa  101  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  39.57 
 
 
156 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  41.84 
 
 
158 aa  100  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 
143 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  34.09 
 
 
176 aa  99.8  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  37.75 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  41.84 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  41.73 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  38.3 
 
 
307 aa  94.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  38.73 
 
 
290 aa  94.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  38.85 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  42.25 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  39.16 
 
 
144 aa  91.7  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  36.62 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  38.46 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 
164 aa  90.5  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.55 
 
 
155 aa  88.6  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  37.5 
 
 
280 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.33 
 
 
154 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  37.41 
 
 
208 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  38.62 
 
 
300 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  40.29 
 
 
138 aa  87.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  36.94 
 
 
167 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  35.92 
 
 
142 aa  87  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  36.55 
 
 
151 aa  87  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.88 
 
 
142 aa  87  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
148 aa  87  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  35.86 
 
 
305 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  43.48 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  35.46 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  37.93 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  40.69 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36.91 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  34.03 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  38.13 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  37.58 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  38.13 
 
 
300 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  39.42 
 
 
297 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  35.14 
 
 
164 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  34.46 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  37.76 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  38.3 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  37.16 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  32.14 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34.27 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  35.66 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  36.5 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  34.25 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.11 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  36.05 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  34.97 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  36.36 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  32.17 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  36.91 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  33.81 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>