More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1706 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  100 
 
 		 130 aa  263  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  41.54 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  43.85 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  43.85 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  43.41 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  43.75 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  43.85 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  41.67 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  40.62 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  42.97 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  38.28 
 
 		 145 aa  95.9  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  39.06 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  39.06 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  37.88 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  39.06 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  37.6 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.6 
 
 		 180 aa  92.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  39.68 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  41.41 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  38.76 
 
 		 165 aa  89.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.51 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  38.4 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.02 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  40.16 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  36.51 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  37.8 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  35.77 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.2 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  38.4 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.4 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  45.78 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  35.48 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.72 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  37.08 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  41.38 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  36 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.51 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.54 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.54 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  37.93 
 
 		 169 aa  70.1  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  38.2 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  34.13 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.06 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  32.54 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  50 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  50.77 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  46.27 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.89 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.54 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  33.03 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  35.83 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  35.83 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 151 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  39.77 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  34.68 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.56 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  33.85 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  36.29 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  34.68 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  41.98 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  38.82 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  32.8 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  33.06 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  30.67 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  46.88 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  39.36 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.58 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  33.59 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.35 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  30.71 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  36.96 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.53 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  34.13 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  34.13 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  39.51 
 
 		 280 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.44 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.54 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  50.94 
 
 		 314 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  37.93 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.77 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  36.99 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  50 
 
 		 296 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  44.83 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  42.37 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.03 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  30.83 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  42.03 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.35 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>