More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2830 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2830  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 269 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1137  MscS Mechanosensitive ion channel  45.98 
 
 		 276 aa  236  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  40.98 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  30.2 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  28.4 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  27.75 
 
 		 270 aa  99  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0849  MscS mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 373 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  23.77 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  23.61 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1524  mechanosensitive ion channel  22.92 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  27.9 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02267  hypothetical protein  27.49 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  32.5 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 853 aa  75.5  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  27.59 
 
 		 825 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  26 
 
 		 813 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 859 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  35.05 
 
 		 866 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 		 845 aa  68.9  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.83 
 
 		 806 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 830 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.54 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  27.54 
 
 		 808 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1435  hypothetical protein  26.04 
 
 		 983 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  27.54 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  27.54 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 803 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 799 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 		 814 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 636 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 636 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1549  hypothetical protein  30 
 
 		 983 aa  65.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  36.61 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  31.58 
 
 		 494 aa  65.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 685 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  37.18 
 
 		 849 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 803 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  24.86 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.26 
 
 		 773 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 860 aa  65.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  36.47 
 
 		 833 aa  65.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  37.18 
 
 		 847 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  37.18 
 
 		 847 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  26.34 
 
 		 1144 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  27.64 
 
 		 832 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 816 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  23.84 
 
 		 809 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  34.82 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 		 815 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  35.37 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 832 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 		 840 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  25.13 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 		 867 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  37.38 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 879 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  27.47 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  37.11 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  25.44 
 
 		 814 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  29.87 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 883 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 855 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.81 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 796 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  23.64 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  25.44 
 
 		 820 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  26.23 
 
 		 832 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  25.44 
 
 		 820 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  32.97 
 
 		 804 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2052  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 810 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  37.62 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 		 803 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  22.22 
 
 		 779 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 813 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 		 439 aa  62  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 909 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 947 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  37.14 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  25.73 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 910 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  36.56 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  39.71 
 
 		 637 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  30.77 
 
 		 624 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 785 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  30.5 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>