More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01887 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  59.03 
 
 		 581 aa  664    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  53.78 
 
 		 673 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  100 
 
 		 630 aa  1301    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  58.56 
 
 		 624 aa  739    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  62.68 
 
 		 653 aa  712    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  62.04 
 
 		 668 aa  705    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  60.6 
 
 		 650 aa  778    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  53.64 
 
 		 761 aa  685    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  53.82 
 
 		 704 aa  693    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  56.7 
 
 		 709 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  60.64 
 
 		 676 aa  755    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  52.93 
 
 		 766 aa  692    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  55.8 
 
 		 709 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  53.8 
 
 		 736 aa  695    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  52.65 
 
 		 715 aa  688    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  61.94 
 
 		 667 aa  777    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  60.61 
 
 		 610 aa  730    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  49.83 
 
 		 626 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  45.86 
 
 		 579 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  44.04 
 
 		 565 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  40.87 
 
 		 534 aa  392  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  30.48 
 
 		 574 aa  240  5.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 		 459 aa  99.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.78 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  22.14 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  22.43 
 
 		 654 aa  74.3  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 		 758 aa  72  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  26.49 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  21.81 
 
 		 1401 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  25.08 
 
 		 593 aa  68.2  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  38.06 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  24.75 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  28.74 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  24.92 
 
 		 572 aa  67.8  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  21.8 
 
 		 1401 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  25.8 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  31.61 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  23.43 
 
 		 1307 aa  64.3  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.63 
 
 		 1975 aa  63.9  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  27.61 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 		 541 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 599 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  29.1 
 
 		 441 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  24.66 
 
 		 568 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  19.35 
 
 		 543 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  25.72 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  22.57 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  23.04 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0143  alpha amylase catalytic sub domain protein  26.71 
 
 		 692 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0052779  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  24.21 
 
 		 607 aa  62  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  24.32 
 
 		 565 aa  62  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  32.09 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  26.72 
 
 		 1017 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  23.31 
 
 		 640 aa  62  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0792  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  24.59 
 
 		 604 aa  60.8  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  27.45 
 
 		 1074 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  21.39 
 
 		 1092 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  21.69 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  22.1 
 
 		 493 aa  60.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  26.69 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  32.69 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.75 
 
 		 2068 aa  59.7  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  22.16 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  25.35 
 
 		 541 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  32.69 
 
 		 715 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  24.52 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  26.22 
 
 		 533 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  28.41 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  29.59 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1785  alpha amylase, catalytic region  34.09 
 
 		 724 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  30.38 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  23.88 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  22.36 
 
 		 609 aa  58.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  23.79 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  25.22 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 		 593 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  22.63 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  26.82 
 
 		 728 aa  57.8  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  25.17 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  28.99 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  23.71 
 
 		 1942 aa  57.4  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  19.93 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  20.03 
 
 		 600 aa  57  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  24.61 
 
 		 560 aa  57  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  22.45 
 
 		 586 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  22.29 
 
 		 583 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 		 1075 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  23.86 
 
 		 562 aa  56.6  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  24.29 
 
 		 450 aa  56.6  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  32.43 
 
 		 671 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  25.22 
 
 		 644 aa  57  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  22.15 
 
 		 560 aa  56.6  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  22.11 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  25.8 
 
 		 544 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  22.85 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  27.01 
 
 		 622 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  24.79 
 
 		 515 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.23 
 
 		 1855 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>