247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1374 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  453  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  50.93 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  44.56 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  44.17 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 209 aa  106  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.24 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  27.8 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 186 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0546  regulatory protein TetR  28.21 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  19.28 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  19.28 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 332 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 308 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  25.82 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  28.93 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  27.17 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  22.45 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  26.92 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>