More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2115 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 536 aa  1108    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.5 
 
 		 637 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  44.53 
 
 		 775 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  49.61 
 
 		 410 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  37.74 
 
 		 649 aa  276  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  37.15 
 
 		 637 aa  276  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  34.79 
 
 		 642 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  49.02 
 
 		 1079 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  37.56 
 
 		 637 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  34.6 
 
 		 642 aa  260  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  49.21 
 
 		 1100 aa  256  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  35.31 
 
 		 853 aa  253  7e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  34.59 
 
 		 754 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  47.04 
 
 		 1087 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  46.99 
 
 		 1087 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  34.76 
 
 		 684 aa  243  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  44.31 
 
 		 1082 aa  233  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  45.49 
 
 		 1083 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  44.12 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.43 
 
 		 396 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.05 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.48 
 
 		 563 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.35 
 
 		 688 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  35.41 
 
 		 706 aa  169  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  37.25 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.86 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  37.25 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.48 
 
 		 482 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.83 
 
 		 423 aa  163  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  35.88 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  31.19 
 
 		 447 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.88 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  35.83 
 
 		 708 aa  160  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.25 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  37.64 
 
 		 455 aa  158  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 1676 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.52 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  31.23 
 
 		 612 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  31.2 
 
 		 474 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  34.98 
 
 		 687 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  33.09 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  32.84 
 
 		 460 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  33.84 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 619 aa  150  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 1047 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  31.46 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  31.46 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  29.2 
 
 		 840 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 968 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1464  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.25 
 
 		 1139 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  35.16 
 
 		 705 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.81 
 
 		 572 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 797 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  30.8 
 
 		 631 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.47 
 
 		 997 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  32.73 
 
 		 846 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  29.53 
 
 		 445 aa  139  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 		 812 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.98 
 
 		 1004 aa  136  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 536 aa  136  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  30.35 
 
 		 462 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.24 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 1390 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.06 
 
 		 957 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  32.56 
 
 		 821 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.96 
 
 		 1017 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  26.01 
 
 		 519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 		 748 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 793 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.62 
 
 		 995 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  28.33 
 
 		 716 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  31.12 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  27.85 
 
 		 445 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  33.19 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  31.3 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.2 
 
 		 961 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 		 632 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 845 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 409 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.24 
 
 		 590 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  31.97 
 
 		 648 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.53 
 
 		 678 aa  127  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  29.8 
 
 		 413 aa  127  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.06 
 
 		 486 aa  127  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  31.45 
 
 		 378 aa  126  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  32.92 
 
 		 361 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  30.04 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.34 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  28.08 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  30.89 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  33.58 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1892  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.26 
 
 		 771 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  29.81 
 
 		 570 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.18 
 
 		 497 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  29.22 
 
 		 364 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.06 
 
 		 1165 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.55 
 
 		 496 aa  123  9e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  27.24 
 
 		 705 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  28.79 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  30.71 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>