More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2858 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  56.65 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  52.76 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  49.28 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  48.21 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  50.5 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  51.04 
 
 		 215 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  47.37 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  48.21 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  45.93 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  45.93 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  45.93 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  48.53 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  40.41 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  44.28 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  46.49 
 
 		 209 aa  154  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  40.69 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  39.71 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  40.8 
 
 		 215 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  40.3 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  40.3 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  40.51 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  48.37 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  38 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  38.05 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  39.7 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  38.16 
 
 		 231 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  35.38 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  37.38 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  37.31 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 		 236 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  31.92 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  31.71 
 
 		 229 aa  88.6  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 		 235 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 191 aa  85.5  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  32.48 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32.82 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  31.63 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  31.73 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  28.16 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2915  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  34.45 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  36.89 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 		 228 aa  72  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  34.45 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  31.58 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  27.46 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.05 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.27 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  27.46 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.34 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  34.94 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  33.16 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>