More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3328 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  45.99 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 209 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 198 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 208 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  34.72 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 214 aa  92.4  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  52.05 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  58.93 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  44.12 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  30.47 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  32.47 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  46.75 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  26.87 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  46.88 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  43.75 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  46.88 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 497 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  32.6 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>