More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3240 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 195 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  43.38 
 
 		 145 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  32.68 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  39.13 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 240 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 176 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  26.76 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2659  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144734  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 635 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 288 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  38.16 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 234 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 263 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 309 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 245 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  37.68 
 
 		 237 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>