More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3116 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  66.6 
 
 		 549 aa  721    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  61.14 
 
 		 545 aa  656    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 522 aa  1050    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  62.76 
 
 		 536 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  60.22 
 
 		 568 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  57.27 
 
 		 562 aa  598  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  55.23 
 
 		 561 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  54.84 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  52.18 
 
 		 565 aa  522  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.19 
 
 		 561 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  50.46 
 
 		 561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  49.43 
 
 		 520 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.58 
 
 		 523 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.81 
 
 		 520 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.99 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  48 
 
 		 520 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  47.33 
 
 		 592 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  46.29 
 
 		 520 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.37 
 
 		 519 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.38 
 
 		 520 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.29 
 
 		 522 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.56 
 
 		 522 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.94 
 
 		 548 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  39.47 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  33.4 
 
 		 523 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.33 
 
 		 565 aa  229  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  34.64 
 
 		 551 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  31.56 
 
 		 557 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  31.71 
 
 		 557 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  32.55 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  30.72 
 
 		 598 aa  203  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  32.21 
 
 		 562 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  29.36 
 
 		 551 aa  197  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.22 
 
 		 533 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  31.34 
 
 		 551 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  30.21 
 
 		 571 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  30.02 
 
 		 571 aa  189  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  30.02 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  30.02 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  29.82 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  30.02 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  27.82 
 
 		 530 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  28.97 
 
 		 596 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  36.24 
 
 		 765 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  29.11 
 
 		 531 aa  177  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.16 
 
 		 526 aa  174  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.64 
 
 		 526 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.62 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  27.1 
 
 		 529 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.53 
 
 		 474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.06 
 
 		 593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.82 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  27.39 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.05 
 
 		 613 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  25.33 
 
 		 569 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  28.09 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  25.88 
 
 		 565 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  26.86 
 
 		 562 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  26.16 
 
 		 566 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.17 
 
 		 486 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.22 
 
 		 567 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  26.15 
 
 		 564 aa  124  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  25.9 
 
 		 560 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.25 
 
 		 542 aa  120  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.82 
 
 		 550 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  24.8 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  24.72 
 
 		 505 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  24.49 
 
 		 505 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.31 
 
 		 513 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  25.93 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  25.52 
 
 		 522 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  22.99 
 
 		 566 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  24.87 
 
 		 527 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  23.4 
 
 		 509 aa  95.9  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  23.08 
 
 		 527 aa  94  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.46 
 
 		 892 aa  93.6  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.28 
 
 		 529 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  25.17 
 
 		 530 aa  92  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  23.54 
 
 		 526 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  19.82 
 
 		 581 aa  87.8  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  23.99 
 
 		 483 aa  87.4  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.17 
 
 		 510 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  24.18 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.17 
 
 		 510 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  23.42 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  23.6 
 
 		 570 aa  85.1  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  28.72 
 
 		 581 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  24.71 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1893  Na+/myo-inositol cotransporter  32.13 
 
 		 234 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0549999  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.02 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.02 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.02 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.02 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  27.65 
 
 		 570 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  24.83 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  26.48 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.89 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.95 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  24.65 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  24.93 
 
 		 556 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>