57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0594 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  846    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  34.96 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  38.86 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 654 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 537 aa  92.8  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 771 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 764 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  22.73 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.88 
 
 		 799 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3601  hypothetical protein  27.74 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.897301  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  22.74 
 
 		 649 aa  70.1  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  21.88 
 
 		 742 aa  69.7  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.81 
 
 		 784 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  20.47 
 
 		 781 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  24.2 
 
 		 758 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  25 
 
 		 708 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  22.17 
 
 		 778 aa  63.5  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  29.12 
 
 		 767 aa  63.5  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  23.54 
 
 		 755 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  24.34 
 
 		 651 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  21.91 
 
 		 773 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  23.64 
 
 		 743 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 802 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  21.23 
 
 		 697 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  21.28 
 
 		 817 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 764 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  18.36 
 
 		 687 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  21.05 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 729 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  21.9 
 
 		 640 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  22.81 
 
 		 469 aa  49.7  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  26.52 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  22.37 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  27.62 
 
 		 540 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  23.3 
 
 		 286 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  28.19 
 
 		 516 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  27.78 
 
 		 317 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  26.94 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  24.64 
 
 		 307 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  22.71 
 
 		 453 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  25 
 
 		 316 aa  46.6  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  26.74 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  27.55 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  23.66 
 
 		 650 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  21.67 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  24.14 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  21.92 
 
 		 563 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  20.92 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  23.48 
 
 		 539 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  24.26 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  25.11 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  23.76 
 
 		 333 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  25.97 
 
 		 314 aa  43.1  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  23.21 
 
 		 650 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  22.43 
 
 		 394 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  24.73 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>