More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3083 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3083  diguanylate cyclase  100 
 
 		 406 aa  839    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2817  hypothetical protein  69.98 
 
 		 406 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890106  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2886  hypothetical protein  69.98 
 
 		 406 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1070  diguanylate cyclase  65.76 
 
 		 407 aa  557  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0137194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2888  hypothetical protein  65.76 
 
 		 407 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00499837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3843  hypothetical protein  65.51 
 
 		 407 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0156897  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02493  predicted diguanylate cyclase  65.26 
 
 		 408 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.196527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2763  hypothetical protein  65.26 
 
 		 407 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000512321  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2756  hypothetical protein  65.51 
 
 		 407 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0689329  decreased coverage  0.00382869 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1079  hypothetical protein  65.26 
 
 		 408 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02457  hypothetical protein  65.26 
 
 		 408 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.150678  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2867  hypothetical protein  69.07 
 
 		 379 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00679598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2888  hypothetical protein  68.8 
 
 		 379 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186144  normal  0.300292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3000  hypothetical protein  69.07 
 
 		 379 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0933  diguanylate cyclase  44.7 
 
 		 423 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0673  diguanylate cyclase  35.32 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.685567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3616  diguanylate cyclase  34.87 
 
 		 436 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0820  GGDEF domain-containing protein  34.87 
 
 		 433 aa  255  8e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3487  GGDEF domain-containing protein  34.78 
 
 		 425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49890  hypothetical protein  36.48 
 
 		 435 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.943756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4249  hypothetical protein  35.32 
 
 		 434 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0692  diguanylate cyclase  36.29 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4534  diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 423 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0836312  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4670  GGDEF domain-containing protein  34.24 
 
 		 423 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.406009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4668  diguanylate cyclase  34 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.665798  normal  0.140275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0764  diguanylate cyclase  34.68 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52083  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5027  diguanylate cyclase  34.09 
 
 		 422 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.750126  normal  0.244127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3340  diguanylate cyclase  34.09 
 
 		 422 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5257  diguanylate cyclase  34.34 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2245  diguanylate cyclase  34.61 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.310334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4956  diguanylate cyclase  33.17 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.888162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2222  GGDEF  36.02 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4436  diguanylate cyclase  33.67 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397497  hitchhiker  0.000180692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0644  diguanylate cyclase  33 
 
 		 422 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.596641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3483  diguanylate cyclase  33.52 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0776435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3617  diguanylate cyclase  34.84 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0238  diguanylate cyclase  33.24 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2993  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein, truncated  60.74 
 
 		 139 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.29 
 
 		 721 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.881722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0094  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  28.22 
 
 		 721 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000375041 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0490  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.17 
 
 		 742 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0534462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05220  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1905  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.24 
 
 		 884 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.39821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  32.08 
 
 		 921 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.96 
 
 		 703 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3606  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.18 
 
 		 757 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3629  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.26 
 
 		 850 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739626 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3077  diguanylate cyclase  39.88 
 
 		 437 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.13 
 
 		 1144 aa  106  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.851066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2883  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.13 
 
 		 849 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.68 
 
 		 682 aa  106  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 614 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2561  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.42 
 
 		 836 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1481  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.82 
 
 		 949 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1290  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.12 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0190271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1329  diguanylate cyclase  33.72 
 
 		 565 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1323  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  37.43 
 
 		 449 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.42 
 
 		 1484 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.978359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1678  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.13 
 
 		 612 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3776  diguanylate cyclase  30.4 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5153  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.41 
 
 		 729 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3930  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.04 
 
 		 1497 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3910  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.04 
 
 		 1497 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3853  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.04 
 
 		 1490 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982948  hitchhiker  0.0000000550616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2544  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.9 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.108185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.36 
 
 		 950 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3580  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.24 
 
 		 873 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1534  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.22 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.376143  normal  0.346331 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3745  putative GGDEF/cyclase  41.83 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5214  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.12 
 
 		 1039 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1999  diguanylate cyclase  39.47 
 
 		 612 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3955  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.51 
 
 		 645 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.719162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.24 
 
 		 1247 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0427  sensory box protein  37.65 
 
 		 1491 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4051  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.42 
 
 		 1497 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.996532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.74 
 
 		 1785 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1170  hypothetical protein  36.47 
 
 		 768 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1176  hypothetical protein  36.47 
 
 		 768 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.35 
 
 		 738 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3975  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.47 
 
 		 828 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2778  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.58 
 
 		 1010 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0461  CBS/GGDEF/EAL domain-containing protein  39.38 
 
 		 594 aa  100  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0424  PAS:GGDEF  37.34 
 
 		 715 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000207007  hitchhiker  0.00445241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4673  hypothetical protein  39.41 
 
 		 651 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53310  hypothetical protein  38.55 
 
 		 681 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2753  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.49 
 
 		 1009 aa  99.8  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1336  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.55 
 
 		 1015 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.49 
 
 		 1009 aa  99.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0322  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.65 
 
 		 1481 aa  99.8  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0210085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2685  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.72 
 
 		 706 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1378  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.52 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1326  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.55 
 
 		 1015 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3968  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.15 
 
 		 887 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1362  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.55 
 
 		 1015 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.595031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40 
 
 		 1247 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.41 
 
 		 667 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000118993  normal  0.446718 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0896  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.52 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.225893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3022  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.55 
 
 		 1015 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1356  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.46 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305567 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.37 
 
 		 577 aa  98.2  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>