More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0644 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4956  diguanylate cyclase  87.14 
 
 		 422 aa  676    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.888162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5257  diguanylate cyclase  91.43 
 
 		 422 aa  724    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0644  diguanylate cyclase  100 
 
 		 422 aa  833    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.596641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4436  diguanylate cyclase  87.14 
 
 		 422 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397497  hitchhiker  0.000180692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3340  diguanylate cyclase  90.24 
 
 		 422 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5027  diguanylate cyclase  90.24 
 
 		 422 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.750126  normal  0.244127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3617  diguanylate cyclase  84.6 
 
 		 422 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49890  hypothetical protein  52.37 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.943756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4249  hypothetical protein  51.37 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4670  GGDEF domain-containing protein  51.23 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.406009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4534  diguanylate cyclase  51.23 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0836312  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0692  diguanylate cyclase  52.12 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4668  diguanylate cyclase  51.23 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.665798  normal  0.140275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0673  diguanylate cyclase  51.12 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.685567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0764  diguanylate cyclase  51.7 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52083  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2245  diguanylate cyclase  50 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.310334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3616  diguanylate cyclase  48.08 
 
 		 436 aa  362  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0820  GGDEF domain-containing protein  48.08 
 
 		 433 aa  362  8e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3487  GGDEF domain-containing protein  48.08 
 
 		 425 aa  362  9e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2222  GGDEF  49.25 
 
 		 424 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3483  diguanylate cyclase  46.06 
 
 		 409 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0776435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0238  diguanylate cyclase  39.41 
 
 		 408 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146038  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1070  diguanylate cyclase  33.84 
 
 		 407 aa  216  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0137194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2888  hypothetical protein  33.84 
 
 		 407 aa  216  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00499837  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02493  predicted diguanylate cyclase  33.84 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.196527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2763  hypothetical protein  33.84 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000512321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02457  hypothetical protein  33.84 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.150678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1079  hypothetical protein  33.84 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3843  hypothetical protein  33.84 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0156897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2756  hypothetical protein  33.59 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0689329  decreased coverage  0.00382869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2867  hypothetical protein  36.41 
 
 		 379 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00679598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0933  diguanylate cyclase  33.76 
 
 		 423 aa  212  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2886  hypothetical protein  35.1 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2817  hypothetical protein  35.1 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3083  diguanylate cyclase  33 
 
 		 406 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2888  hypothetical protein  36.41 
 
 		 379 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186144  normal  0.300292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3000  hypothetical protein  35.87 
 
 		 379 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0094  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  35.5 
 
 		 721 aa  173  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000375041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.68 
 
 		 721 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.881722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.99 
 
 		 892 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5479  sensory box/GGDEF family protein  46.39 
 
 		 892 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5471  sensory box/GGDEF family protein  46.39 
 
 		 814 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00599956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.64 
 
 		 682 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5481  sensory box/GGDEF family protein  46.67 
 
 		 735 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242915  hitchhiker  1.94028e-17 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.39 
 
 		 1247 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.78 
 
 		 703 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3241  diguanylate cyclase  39.11 
 
 		 572 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0207551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  46.39 
 
 		 1247 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  46.39 
 
 		 1247 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5527  sensory box/GGDEF family protein  46.67 
 
 		 604 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5048  sensory box/GGDEF family protein  46.39 
 
 		 892 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.39 
 
 		 1247 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.56 
 
 		 1147 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5197  sensory box/GGDEF family protein  46.39 
 
 		 892 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.619616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5032  hypothetical protein  46.39 
 
 		 892 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5593  sensory box/GGDEF family protein  46.39 
 
 		 892 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5441  sensory box/GGDEF family protein  46.39 
 
 		 735 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  47.27 
 
 		 499 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  46.99 
 
 		 1245 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.78 
 
 		 1248 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  46.99 
 
 		 1245 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.62 
 
 		 947 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4673  hypothetical protein  51.92 
 
 		 651 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53310  hypothetical protein  50.64 
 
 		 681 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.98 
 
 		 1244 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3776  diguanylate cyclase  35.78 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.03 
 
 		 681 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1297  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.5 
 
 		 891 aa  145  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.112988  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3861  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.83 
 
 		 980 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.861278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  49.69 
 
 		 720 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2451  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  49.7 
 
 		 802 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312082 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4937  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.83 
 
 		 980 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.157609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3606  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.1 
 
 		 757 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1329  diguanylate cyclase  41.89 
 
 		 565 aa  143  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.7 
 
 		 954 aa  142  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4642  PAS:GGDEF  44.58 
 
 		 828 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2209  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.25 
 
 		 844 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1829  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.31 
 
 		 754 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000110456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.78 
 
 		 582 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.598305  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0604  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  50.93 
 
 		 700 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  48.05 
 
 		 1264 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4938  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.3 
 
 		 1027 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.393519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1542  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.18 
 
 		 1006 aa  141  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3588  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.98 
 
 		 827 aa  141  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0360121 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0966  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.63 
 
 		 1059 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0536  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  44.58 
 
 		 829 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45 
 
 		 1212 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2656  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.07 
 
 		 696 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3448  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.07 
 
 		 696 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.57 
 
 		 1094 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3337  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  45.18 
 
 		 1020 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4876  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.71 
 
 		 730 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3626  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.05 
 
 		 840 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2737  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.17 
 
 		 951 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000925868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3445  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  48.75 
 
 		 1094 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.1 
 
 		 705 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  41.62 
 
 		 882 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5950  diguanylate cyclase  38.81 
 
 		 604 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  40.45 
 
 		 737 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0407  GGDEF domain-containing protein  34.59 
 
 		 873 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0669941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>