More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3843 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02493  predicted diguanylate cyclase  98.53 
 
 		 408 aa  827    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.196527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1070  diguanylate cyclase  99.02 
 
 		 407 aa  832    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0137194  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1079  hypothetical protein  98.53 
 
 		 408 aa  827    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2756  hypothetical protein  97.79 
 
 		 407 aa  821    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0689329  decreased coverage  0.00382869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02457  hypothetical protein  98.53 
 
 		 408 aa  827    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.150678  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2888  hypothetical protein  99.02 
 
 		 407 aa  832    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00499837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2763  hypothetical protein  98.53 
 
 		 407 aa  827    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000512321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3843  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  842    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0156897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2886  hypothetical protein  74.5 
 
 		 406 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2817  hypothetical protein  74.5 
 
 		 406 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890106  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2867  hypothetical protein  76.06 
 
 		 379 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00679598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2888  hypothetical protein  76.33 
 
 		 379 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186144  normal  0.300292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3000  hypothetical protein  76.06 
 
 		 379 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3083  diguanylate cyclase  65.51 
 
 		 406 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0933  diguanylate cyclase  45.36 
 
 		 423 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2993  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein, truncated  96.4 
 
 		 139 aa  283  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3487  GGDEF domain-containing protein  36.52 
 
 		 425 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0820  GGDEF domain-containing protein  36.52 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3616  diguanylate cyclase  36.52 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0673  diguanylate cyclase  35.98 
 
 		 415 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.685567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49890  hypothetical protein  38.83 
 
 		 435 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.943756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4249  hypothetical protein  38.32 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4668  diguanylate cyclase  36.29 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.665798  normal  0.140275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4534  diguanylate cyclase  35.79 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0836312  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2245  diguanylate cyclase  34.66 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.310334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4670  GGDEF domain-containing protein  35.86 
 
 		 423 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.406009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0764  diguanylate cyclase  36.62 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52083  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0692  diguanylate cyclase  34.58 
 
 		 422 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3340  diguanylate cyclase  33.42 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5027  diguanylate cyclase  33.42 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.750126  normal  0.244127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5257  diguanylate cyclase  33.67 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4956  diguanylate cyclase  33.67 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.888162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2222  GGDEF  35.28 
 
 		 424 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4436  diguanylate cyclase  33.92 
 
 		 422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397497  hitchhiker  0.000180692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0644  diguanylate cyclase  33.84 
 
 		 422 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.596641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3617  diguanylate cyclase  34.34 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0238  diguanylate cyclase  31.54 
 
 		 408 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3483  diguanylate cyclase  30.89 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0776435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05220  diguanylate cyclase  42.14 
 
 		 501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5153  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.74 
 
 		 729 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.06 
 
 		 682 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.79 
 
 		 703 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3523  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.82 
 
 		 872 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.68 
 
 		 721 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.881722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0094  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  29.82 
 
 		 721 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000375041 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1534  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.39 
 
 		 642 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.376143  normal  0.346331 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3606  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.43 
 
 		 757 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0490  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.79 
 
 		 742 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0534462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0626  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.3 
 
 		 856 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4673  hypothetical protein  43.45 
 
 		 651 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3484  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.1 
 
 		 717 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.049586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.42 
 
 		 1101 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1905  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.21 
 
 		 884 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.39821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53310  hypothetical protein  42.42 
 
 		 681 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1010  putative response regulator  40 
 
 		 628 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3414  diguanylate cyclase  32.64 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0813  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.61 
 
 		 837 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.461679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1678  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.51 
 
 		 612 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3975  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.01 
 
 		 828 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05442  hypothetical protein  37.28 
 
 		 539 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3711  sensory box protein  41.98 
 
 		 503 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0503901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.06 
 
 		 537 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2343  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.46 
 
 		 921 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.762005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1481  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.12 
 
 		 949 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2766  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.49 
 
 		 782 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.82 
 
 		 917 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3276  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.55 
 
 		 615 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2835  diguanylate cyclase  40 
 
 		 231 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5048  sensory box/GGDEF family protein  39.08 
 
 		 892 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3629  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.87 
 
 		 850 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3580  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.85 
 
 		 873 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5471  sensory box/GGDEF family protein  39.08 
 
 		 814 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00599956  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2375  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.02 
 
 		 790 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2561  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.89 
 
 		 836 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2227  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.38 
 
 		 1275 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5441  sensory box/GGDEF family protein  39.08 
 
 		 735 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2354  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.02 
 
 		 790 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5197  sensory box/GGDEF family protein  39.08 
 
 		 892 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.619616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5032  hypothetical protein  39.08 
 
 		 892 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2057  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.36 
 
 		 699 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0058  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.68 
 
 		 783 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.218721 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5593  sensory box/GGDEF family protein  39.08 
 
 		 892 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2534  sensory box/response regulator  38.16 
 
 		 452 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.12 
 
 		 592 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.1 
 
 		 738 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 882 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5479  sensory box/GGDEF family protein  37.21 
 
 		 892 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2447  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.57 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0257  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.13 
 
 		 703 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2405  sensory box protein  37.35 
 
 		 751 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.547326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.02 
 
 		 1244 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5973  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.75 
 
 		 776 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.67 
 
 		 681 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00077  Intracellular signaling protein (GAF,GGDEF,EAL domains)  35.47 
 
 		 866 aa  100  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5481  sensory box/GGDEF family protein  38.51 
 
 		 735 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242915  hitchhiker  1.94028e-17 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3666  hypothetical protein  36.97 
 
 		 733 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.611695  normal  0.775877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3532  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.41 
 
 		 744 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1245 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1245 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.91 
 
 		 695 aa  99.8  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>