162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2060 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1753  TetR family transcriptional regulator  66.32 
 
 		 192 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1690  TetR family transcriptional regulator  66.32 
 
 		 192 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1692  transcriptional regulator, TetR family  65.79 
 
 		 192 aa  263  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.474881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1586  transcriptional regulator, TetR family  65.79 
 
 		 192 aa  263  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1767  TetR family transcriptional regulator  65.26 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 287 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 308 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 228 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  27.54 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  27.54 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  43.1 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  32.14 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  27.03 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 248 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 221 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  27.27 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 199 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  27.74 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 357 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  23.73 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  28.72 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>