More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2511 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  283  5e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  59.57 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  50 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  40 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  39.29 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  40 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  37.86 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  39.13 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  35.71 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  34.48 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2020  UspA domain protein  37.5 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000426305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  33.1 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  34.04 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  38.3 
 
 		 320 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  39.31 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  34.97 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  33.09 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  31.47 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.42 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.1 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.25 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  35.97 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  33.33 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.87 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  35.62 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.1 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  33.79 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  37.24 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  33.11 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  32.87 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  33.1 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.41 
 
 		 300 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  37.06 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  36.11 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.03 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 274 aa  63.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  31.51 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  32.39 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.37 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.96 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  36.43 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  36.81 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.77 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  36.55 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  38.85 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.37 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  32.64 
 
 		 286 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  34.53 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 170 aa  62  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.67 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  33.77 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.25 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  31.47 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.79 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  35.1 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.15 
 
 		 290 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  28.47 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.77 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  32.39 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  31.91 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  34 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1767  hypothetical protein  32.86 
 
 		 282 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.47 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.07 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  31.21 
 
 		 297 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.33 
 
 		 307 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  32.88 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36.55 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  33.78 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  31.47 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  30 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  38 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>