More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0521 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
394 aa  783    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1133  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.22 
 
 
391 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0793831  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0573  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 
389 aa  169  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000216198  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.25 
 
 
407 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  23.69 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0119  CmeA  24.02 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.84 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  23.47 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  23.32 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.02 
 
 
432 aa  77  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2117  secretion protein HlyD  25.29 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.893928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.15 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.37 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  23.01 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.49 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.49 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  25.37 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  25.18 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.74 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.87 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  22.42 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  24.78 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  23.98 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.79 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  27.72 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.43 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  20.8 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  25.19 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  21.86 
 
 
421 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  21.56 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.85 
 
 
438 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  25.22 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  27.73 
 
 
407 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  23.4 
 
 
372 aa  67  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1962  RND family efflux transporter MFP subunit  20.13 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.18 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  28.12 
 
 
432 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  23.53 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  24.56 
 
 
438 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  22.27 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 
458 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  26.24 
 
 
466 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  26.87 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  21.56 
 
 
471 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  22.18 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  26.15 
 
 
458 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2568  secretion protein HlyD  22.67 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.93 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  24.5 
 
 
461 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  24.39 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.65 
 
 
471 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  23.85 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.48 
 
 
407 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.02 
 
 
362 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 
458 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.3 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  23.12 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1569  RND family efflux transporter MFP subunit  21.56 
 
 
415 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  23.25 
 
 
352 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.67 
 
 
372 aa  63.5  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.19 
 
 
391 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  26.7 
 
 
349 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  21.14 
 
 
421 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  21.18 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  23.5 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.96 
 
 
357 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  25.6 
 
 
268 aa  62.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  22.94 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.39 
 
 
438 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.06 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6350  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.4 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 
451 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  26.17 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  21.28 
 
 
421 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.1 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4376  RND family efflux transporter MFP subunit  19.94 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.349604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.36 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.44 
 
 
478 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  21.33 
 
 
333 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  25.1 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  25.28 
 
 
302 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45910  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  23.62 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.170535  normal  0.980017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4768  RND family efflux transporter MFP subunit  20.91 
 
 
362 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000176985 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 
360 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  29.86 
 
 
428 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  23.19 
 
 
366 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.34 
 
 
442 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  30.34 
 
 
345 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  20.93 
 
 
421 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  25.87 
 
 
403 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  24.23 
 
 
409 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  28.05 
 
 
373 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>