More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0258 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 220 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  46.08 
 
 		 217 aa  201  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  47.47 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.4 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.74 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  42.72 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  41.94 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.33 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.5 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.63 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.2 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  35.19 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.43 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.89 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.89 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  37.33 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  36.49 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  38.5 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.41 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  38.81 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.09 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1983  Phosphoglycolate phosphatase  39.76 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  38.68 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.27 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.71 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.18 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.14 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.73 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  37.7 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  37.7 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  37.14 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.57 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.64 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  35.22 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.36 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  37.14 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  37.14 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  35.21 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  34.86 
 
 		 461 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  34.01 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.67 
 
 		 257 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  34.78 
 
 		 272 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  34.36 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  35.07 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  34.78 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  33.04 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  34.4 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  36.13 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  34.02 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 		 233 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  32.66 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  32.64 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 		 226 aa  104  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  37.14 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  31.9 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.58 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  32.64 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  32.64 
 
 		 233 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  32.13 
 
 		 243 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  30.15 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  33.96 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  34.04 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  31.18 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  30.45 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  32.57 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  32.57 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 		 216 aa  98.2  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  32.65 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  32.74 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  32.65 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  29.86 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  31.13 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  34.6 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  31.8 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  33.51 
 
 		 251 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 254 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>