90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2430 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2430  spermine synthase  100 
 
 		 704 aa  1404    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  25.13 
 
 		 805 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  26.27 
 
 		 757 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  25.7 
 
 		 1078 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  28.11 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1079 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  25.48 
 
 		 1078 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  31.55 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  27.48 
 
 		 521 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  27.78 
 
 		 503 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  25.56 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  25.75 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  28.12 
 
 		 504 aa  72  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  28.67 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  28.67 
 
 		 504 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  25.88 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  28.03 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  28.03 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  28.03 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  23.69 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  25.05 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  35.12 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  22.92 
 
 		 541 aa  67.4  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  26.78 
 
 		 538 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  34.55 
 
 		 522 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  25.35 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  25.35 
 
 		 525 aa  64.3  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  32.53 
 
 		 520 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  32.53 
 
 		 520 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  25.9 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  25.9 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  25.5 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  27.65 
 
 		 520 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  26.08 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  26.08 
 
 		 521 aa  59.3  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  28.24 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  29.59 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  25.48 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  29.59 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  25.1 
 
 		 749 aa  58.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  23.83 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  23.2 
 
 		 568 aa  57.4  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  24.17 
 
 		 283 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  22.58 
 
 		 570 aa  56.6  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  27.41 
 
 		 567 aa  56.6  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  25.13 
 
 		 1017 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  24.89 
 
 		 991 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  25.96 
 
 		 529 aa  55.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  26.32 
 
 		 520 aa  54.7  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  29.14 
 
 		 837 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  25.84 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  25.65 
 
 		 982 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  22.73 
 
 		 575 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  28.5 
 
 		 903 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  23.7 
 
 		 283 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  23.03 
 
 		 595 aa  52  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  24.43 
 
 		 577 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  24.43 
 
 		 577 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  27.85 
 
 		 842 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  43.55 
 
 		 574 aa  50.8  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  26.44 
 
 		 533 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0625  spermidine synthase  22.96 
 
 		 575 aa  49.7  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.415321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  24.1 
 
 		 577 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  26.69 
 
 		 876 aa  49.3  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  27.18 
 
 		 782 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  30.14 
 
 		 375 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  29.55 
 
 		 275 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  28.33 
 
 		 692 aa  48.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0724  spermidine synthase  21.99 
 
 		 576 aa  48.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105401  hitchhiker  0.00000291342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  23.39 
 
 		 681 aa  47.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  28.47 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  27.43 
 
 		 521 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0914  spermidine synthase  41.94 
 
 		 574 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.013206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0924  spermidine synthase  41.94 
 
 		 574 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0890  spermidine synthase  41.94 
 
 		 574 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.164164  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3089  spermidine synthase  40.32 
 
 		 574 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170369  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3448  spermidine synthase  41.94 
 
 		 574 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  27.52 
 
 		 360 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  27.52 
 
 		 360 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  27.52 
 
 		 360 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  23.33 
 
 		 283 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  27.78 
 
 		 490 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  27.52 
 
 		 360 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  26.97 
 
 		 326 aa  45.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  22.3 
 
 		 558 aa  45.8  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  29.45 
 
 		 363 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  35.25 
 
 		 255 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  27.52 
 
 		 369 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  24.61 
 
 		 844 aa  45.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  23.55 
 
 		 516 aa  44.3  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>