More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2410 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 648 aa  1325    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  46.42 
 
 		 879 aa  501  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  55.82 
 
 		 559 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 759 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 		 645 aa  331  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 715 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 744 aa  320  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 534 aa  294  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 790 aa  290  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 795 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 748 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.57 
 
 		 576 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 776 aa  154  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 686 aa  150  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  34.69 
 
 		 598 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 762 aa  135  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.66 
 
 		 641 aa  134  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 827 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 643 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 556 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  28.82 
 
 		 546 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 593 aa  120  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 589 aa  117  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  26.52 
 
 		 559 aa  115  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 587 aa  114  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.22 
 
 		 536 aa  111  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  26.77 
 
 		 460 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 686 aa  106  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 766 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 792 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.71 
 
 		 810 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 581 aa  100  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 878 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  27.59 
 
 		 571 aa  99  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  25.12 
 
 		 437 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.21 
 
 		 725 aa  97.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 		 1737 aa  94.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 3145 aa  94.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 808 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 1406 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 585 aa  91.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 638 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 613 aa  87.4  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.16 
 
 		 1022 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 847 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.63 
 
 		 632 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  23.23 
 
 		 582 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 927 aa  84  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  33.33 
 
 		 575 aa  84  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.86 
 
 		 1056 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 291 aa  83.2  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 292 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  27.55 
 
 		 572 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 3172 aa  82  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.9 
 
 		 622 aa  81.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.27 
 
 		 784 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.27 
 
 		 818 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.09 
 
 		 1056 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.34 
 
 		 764 aa  80.9  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.75 
 
 		 745 aa  80.5  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 909 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.2 
 
 		 462 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 		 988 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 681 aa  79  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 828 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1085 aa  78.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 689 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 1252 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 1252 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 570 aa  77.8  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 685 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 828 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  26.36 
 
 		 581 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  25.78 
 
 		 706 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 739 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.07 
 
 		 2240 aa  75.1  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 1486 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.89 
 
 		 706 aa  74.3  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 637 aa  73.9  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  28.72 
 
 		 306 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  32 
 
 		 1154 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 789 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 718 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 605 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 		 3301 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 1421 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.74 
 
 		 681 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.12 
 
 		 1694 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.14 
 
 		 576 aa  71.2  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.69 
 
 		 653 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25.35 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.01 
 
 		 733 aa  70.5  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 274 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 602 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>