100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1654 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  65.86 
 
 		 785 aa  998    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  100 
 
 		 754 aa  1514    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 509 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  30.57 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  28.54 
 
 		 433 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1541  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 769 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  24.73 
 
 		 470 aa  103  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  27.21 
 
 		 930 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  30.52 
 
 		 501 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  26.97 
 
 		 502 aa  94  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  27.9 
 
 		 457 aa  88.6  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  27.4 
 
 		 438 aa  87  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  25.43 
 
 		 452 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  29.81 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6500  O-antigen polymerase  30.19 
 
 		 794 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  26.07 
 
 		 773 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  25.7 
 
 		 686 aa  67.4  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  25.71 
 
 		 472 aa  67.4  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  25.7 
 
 		 686 aa  67.4  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  29.68 
 
 		 540 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  27.97 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  31.01 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  23.28 
 
 		 735 aa  63.9  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  27.85 
 
 		 402 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2985  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  33.33 
 
 		 474 aa  62  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  28.71 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  25.53 
 
 		 737 aa  60.1  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  31.03 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  27.18 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3781  O-antigen polymerase  28.19 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  25.32 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  25 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  28.07 
 
 		 845 aa  57.4  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  28.36 
 
 		 549 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  27.68 
 
 		 531 aa  55.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  28.92 
 
 		 438 aa  54.7  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4815  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 466 aa  54.3  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.629862  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  30.08 
 
 		 605 aa  54.3  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  25.81 
 
 		 471 aa  53.9  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  26.98 
 
 		 467 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  30.08 
 
 		 784 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  22.61 
 
 		 436 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  26.33 
 
 		 607 aa  52  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3440  O-antigen polymerase  34.23 
 
 		 508 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  26.75 
 
 		 588 aa  51.6  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  29.53 
 
 		 467 aa  51.6  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  28.05 
 
 		 404 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  25.31 
 
 		 435 aa  51.2  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3233  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  32.65 
 
 		 474 aa  51.2  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  23.81 
 
 		 425 aa  50.8  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  26.99 
 
 		 404 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  26.99 
 
 		 404 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  26.99 
 
 		 404 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3152  O-antigen polymerase  26.46 
 
 		 546 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1584  O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 463 aa  50.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.791545  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.05 
 
 		 457 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  24.85 
 
 		 444 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  27.61 
 
 		 404 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  30.69 
 
 		 436 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1703  O-antigen polymerase  24.41 
 
 		 492 aa  49.3  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  25.23 
 
 		 457 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  25.29 
 
 		 454 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  26.99 
 
 		 404 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  25.12 
 
 		 437 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  29.01 
 
 		 474 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  27.07 
 
 		 517 aa  48.5  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  28.03 
 
 		 1070 aa  48.9  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  27.07 
 
 		 517 aa  48.5  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  24.68 
 
 		 470 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  26.38 
 
 		 438 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 174 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  29.17 
 
 		 416 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  23.96 
 
 		 431 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 503 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  26.76 
 
 		 438 aa  46.6  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  28.71 
 
 		 501 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  27.01 
 
 		 806 aa  46.6  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  29.27 
 
 		 464 aa  45.8  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  25.21 
 
 		 504 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  31 
 
 		 545 aa  45.8  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  24.21 
 
 		 426 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  25.53 
 
 		 874 aa  45.4  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  28.57 
 
 		 389 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 422 aa  45.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  24.5 
 
 		 426 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0122  O-antigen polymerase  23.48 
 
 		 1065 aa  45.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  32.63 
 
 		 437 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  24.02 
 
 		 428 aa  45.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  24.27 
 
 		 561 aa  45.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 595 aa  44.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  24.6 
 
 		 446 aa  45.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 556 aa  44.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 174 aa  44.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4268  O-antigen polymerase  24.73 
 
 		 448 aa  44.3  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3247  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 452 aa  44.3  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  22.71 
 
 		 612 aa  44.3  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  25 
 
 		 532 aa  44.3  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  31.62 
 
 		 595 aa  43.9  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  26.13 
 
 		 500 aa  43.9  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  22.92 
 
 		 446 aa  44.3  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>