More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0688 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  88.58 
 
 		 472 aa  837    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  100 
 
 		 471 aa  936    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  80.21 
 
 		 471 aa  785    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  80.85 
 
 		 471 aa  790    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  60.9 
 
 		 472 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  60.9 
 
 		 476 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  60.04 
 
 		 472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  60.04 
 
 		 472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  59.83 
 
 		 472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  58 
 
 		 473 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  60.21 
 
 		 474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  34.42 
 
 		 469 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  33.7 
 
 		 472 aa  299  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  34.42 
 
 		 463 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  25.96 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.18 
 
 		 475 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.64 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  27.08 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  28.27 
 
 		 483 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  23.04 
 
 		 461 aa  107  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  28.53 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.45 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  24.45 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  24.45 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  24.45 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  24.45 
 
 		 459 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  23.29 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.7 
 
 		 459 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.66 
 
 		 533 aa  90.9  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.43 
 
 		 530 aa  90.1  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  25.52 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.39 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.1 
 
 		 520 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  22.28 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  23.39 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.59 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.72 
 
 		 522 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.47 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.61 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  22.16 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25.94 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  25.94 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  22.22 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  22.81 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  24.12 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  22.96 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  23.85 
 
 		 506 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.86 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  23.82 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  23.04 
 
 		 520 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  25.86 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  22.38 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  23.44 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.22 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  22.84 
 
 		 592 aa  73.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  22.86 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.42 
 
 		 567 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  24.1 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  25.28 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  23.32 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2325  Na+/solute symporter  24.37 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00258865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  22.05 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  23.68 
 
 		 519 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  22.43 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  23.46 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.25 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  21.39 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  24.6 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.98 
 
 		 526 aa  70.1  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  20.9 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  22.31 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.28 
 
 		 519 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  21.86 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  22.01 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  21.98 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.44 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  23.83 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  22.5 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  22.31 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.29 
 
 		 500 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  23.93 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  21.14 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  22.73 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  24.71 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  22.27 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  23.55 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.58 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  22.5 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  22.22 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  23.9 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  21.97 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  22.06 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.69 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.03 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  22.41 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  22.27 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  22.38 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  21.73 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  25.27 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>