More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7201 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7201  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 447 aa  881    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  38.73 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  35.59 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  36.43 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7721  extracellular solute-binding protein family 1  35.74 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.55 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  31.27 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.43 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0234  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.497123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.73 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1045  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0733801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  30.97 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 427 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.28 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.06 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.89 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  32 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.72 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  27.29 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 520 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  32.14 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.05 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 421 aa  66.6  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.8 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  31.63 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.21 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.94 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.21 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.59 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  21.04 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.03 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 432 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.57 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  30.72 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 459 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>