273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3971 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  100 
 
 		 1060 aa  2140    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  28.56 
 
 		 1153 aa  236  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  28.97 
 
 		 1143 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  26.53 
 
 		 1124 aa  233  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.83 
 
 		 1016 aa  212  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  25.69 
 
 		 1131 aa  185  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  22.75 
 
 		 1051 aa  179  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  23.7 
 
 		 1086 aa  176  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.83 
 
 		 1085 aa  174  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  27.83 
 
 		 1071 aa  164  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  25.38 
 
 		 1112 aa  162  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  26.73 
 
 		 1128 aa  161  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  22.68 
 
 		 1083 aa  161  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  26.16 
 
 		 1077 aa  160  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  25.85 
 
 		 1109 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  24.32 
 
 		 1086 aa  159  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  26.3 
 
 		 1072 aa  158  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  25.98 
 
 		 1086 aa  156  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  23.09 
 
 		 1052 aa  155  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  24.61 
 
 		 1067 aa  155  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  26.15 
 
 		 1064 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  24.93 
 
 		 1075 aa  151  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  24.31 
 
 		 1081 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  24.58 
 
 		 1078 aa  147  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  25.33 
 
 		 1065 aa  147  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  24.68 
 
 		 1075 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.23 
 
 		 1080 aa  145  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  23.99 
 
 		 1069 aa  143  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  23.92 
 
 		 1087 aa  142  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.92 
 
 		 1127 aa  140  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  25.03 
 
 		 1100 aa  138  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1065 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  24.52 
 
 		 1077 aa  135  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  23.75 
 
 		 1074 aa  134  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  22 
 
 		 1075 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  26.92 
 
 		 1140 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  23.93 
 
 		 1082 aa  129  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  25.17 
 
 		 853 aa  128  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  22.99 
 
 		 1099 aa  128  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  22.67 
 
 		 1065 aa  125  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  23.92 
 
 		 1077 aa  124  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  23.3 
 
 		 1089 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  22.21 
 
 		 1117 aa  115  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  33.33 
 
 		 1153 aa  107  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  20.02 
 
 		 1109 aa  106  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  23.17 
 
 		 1160 aa  103  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  25.26 
 
 		 1125 aa  102  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  23.84 
 
 		 1053 aa  101  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  25.62 
 
 		 1090 aa  99  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  23.36 
 
 		 1122 aa  95.9  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  23.68 
 
 		 696 aa  89.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  23.92 
 
 		 1078 aa  85.5  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  35.34 
 
 		 1037 aa  76.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  38.21 
 
 		 972 aa  75.5  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  41.86 
 
 		 1046 aa  74.3  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  32.97 
 
 		 963 aa  72.8  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  47.44 
 
 		 962 aa  70.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  29.94 
 
 		 955 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  40.96 
 
 		 1065 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  40.96 
 
 		 1065 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  32.67 
 
 		 1187 aa  69.3  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  29.35 
 
 		 951 aa  69.7  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  36.52 
 
 		 1169 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  36.52 
 
 		 1169 aa  68.9  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  54.24 
 
 		 966 aa  68.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  35.42 
 
 		 541 aa  67.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  27.5 
 
 		 964 aa  67.4  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  30.41 
 
 		 947 aa  67.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  52.54 
 
 		 933 aa  67.8  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  52.54 
 
 		 969 aa  67.8  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  37.5 
 
 		 1167 aa  67  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  36.54 
 
 		 1167 aa  66.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.53 
 
 		 961 aa  66.6  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  50 
 
 		 665 aa  65.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  35.14 
 
 		 941 aa  65.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  35.14 
 
 		 941 aa  65.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  36.54 
 
 		 1167 aa  65.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  32.72 
 
 		 555 aa  65.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  46.88 
 
 		 1043 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  34.33 
 
 		 578 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  33.13 
 
 		 942 aa  65.5  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  53.45 
 
 		 933 aa  65.1  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  31.85 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  33.33 
 
 		 929 aa  65.1  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  33.96 
 
 		 1172 aa  64.7  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  43.9 
 
 		 968 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  33.04 
 
 		 932 aa  64.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  42.86 
 
 		 774 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  34.29 
 
 		 1013 aa  64.3  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  34.62 
 
 		 982 aa  64.3  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  36.54 
 
 		 1170 aa  64.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3181  helicase domain protein  31.37 
 
 		 1088 aa  63.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  41.03 
 
 		 1172 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  27.45 
 
 		 1168 aa  63.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  33.04 
 
 		 760 aa  63.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  30.22 
 
 		 963 aa  62.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  34.82 
 
 		 584 aa  63.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  30.36 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  41.1 
 
 		 1194 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  39.29 
 
 		 1170 aa  62.4  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>