234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1711 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  100 
 
 		 226 aa  447  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  59.64 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  55.95 
 
 		 228 aa  248  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 268 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 272 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 223 aa  88.2  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 263 aa  88.2  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  31.29 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.89 
 
 		 260 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 193 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 253 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  32.89 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  28.97 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30.49 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  27.56 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  29.78 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 283 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  26.82 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  29.26 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  32.89 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  28.02 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  30.61 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  35.67 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>