64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01820 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  100 
 
 
571 aa  1177    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  34.45 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  34.4 
 
 
368 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  33.33 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  33.06 
 
 
634 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.52 
 
 
1072 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  31.87 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  33.08 
 
 
380 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.54 
 
 
489 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  30.97 
 
 
803 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  29.63 
 
 
426 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  35.2 
 
 
801 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.71 
 
 
933 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  27.95 
 
 
890 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  29.6 
 
 
461 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  33.59 
 
 
490 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.25 
 
 
498 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  32.81 
 
 
472 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  29.32 
 
 
469 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30 
 
 
493 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  30 
 
 
451 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  31.71 
 
 
732 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 
516 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  32.54 
 
 
488 aa  60.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  32.03 
 
 
801 aa  60.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  31.75 
 
 
709 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  30 
 
 
801 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  28.19 
 
 
574 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  30 
 
 
547 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  31.1 
 
 
373 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  29.06 
 
 
489 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  30.83 
 
 
374 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  32.79 
 
 
391 aa  58.9  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  30.83 
 
 
558 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.06 
 
 
500 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  31.15 
 
 
1128 aa  57  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  29.01 
 
 
384 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  34.65 
 
 
479 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  28.8 
 
 
492 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  30.95 
 
 
522 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  30.16 
 
 
496 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05720  hypothetical protein  37.19 
 
 
171 aa  55.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  28.46 
 
 
452 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  29.84 
 
 
1207 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  27.2 
 
 
468 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  30.58 
 
 
603 aa  53.5  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  31.67 
 
 
497 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03160  conserved hypothetical protein  32.74 
 
 
206 aa  52  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0440468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  29.69 
 
 
567 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  33.77 
 
 
589 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  26.19 
 
 
476 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  26.14 
 
 
644 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.36 
 
 
627 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  28.33 
 
 
446 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  27.27 
 
 
423 aa  47  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  27.78 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  28.47 
 
 
548 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  26.95 
 
 
653 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2955  hypothetical protein  31.82 
 
 
391 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00044648 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  24.17 
 
 
806 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  31.65 
 
 
672 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.18 
 
 
580 aa  45.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  33.75 
 
 
468 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.05 
 
 
531 aa  43.9  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>