More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3735 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  100 
 
 		 670 aa  1377    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  42.18 
 
 		 669 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  39.94 
 
 		 704 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  39.85 
 
 		 673 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  46.35 
 
 		 694 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  43.65 
 
 		 537 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  43.23 
 
 		 525 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  42.11 
 
 		 517 aa  378  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  39.75 
 
 		 510 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  33.81 
 
 		 658 aa  256  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  33.61 
 
 		 620 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  33.4 
 
 		 631 aa  249  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  31.83 
 
 		 638 aa  247  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  34.3 
 
 		 630 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 		 640 aa  236  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  32.59 
 
 		 641 aa  234  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  32.5 
 
 		 631 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.51 
 
 		 656 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.51 
 
 		 673 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  28.93 
 
 		 648 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  30.83 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  35.12 
 
 		 519 aa  183  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  30.34 
 
 		 679 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  39.37 
 
 		 427 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  40.89 
 
 		 412 aa  151  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 432 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  26.51 
 
 		 671 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  42.01 
 
 		 1313 aa  146  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  28.3 
 
 		 672 aa  145  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  30.36 
 
 		 668 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  24.1 
 
 		 712 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  27.12 
 
 		 626 aa  142  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 		 653 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  28.39 
 
 		 648 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  26.49 
 
 		 643 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  29.89 
 
 		 645 aa  132  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  47.76 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  27.75 
 
 		 903 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  35.38 
 
 		 241 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  26.84 
 
 		 677 aa  127  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  49.62 
 
 		 424 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  24.9 
 
 		 630 aa  124  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  24.54 
 
 		 650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  26.42 
 
 		 660 aa  121  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  34.72 
 
 		 505 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  33.81 
 
 		 464 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  26.64 
 
 		 665 aa  118  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  26.28 
 
 		 710 aa  117  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  23.18 
 
 		 666 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  48.89 
 
 		 380 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  50.89 
 
 		 361 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  26.15 
 
 		 613 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  23.8 
 
 		 656 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  25.56 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 		 586 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  25.11 
 
 		 504 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 1026 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  44.86 
 
 		 320 aa  100  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  33.52 
 
 		 239 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  31.31 
 
 		 300 aa  97.8  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 388 aa  97.1  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 637 aa  94.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 193 aa  94  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  35.11 
 
 		 399 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  43.12 
 
 		 449 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 374 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.5 
 
 		 440 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 		 440 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  26.11 
 
 		 585 aa  91.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  45.54 
 
 		 320 aa  91.3  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  34.23 
 
 		 464 aa  90.5  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  40.37 
 
 		 402 aa  90.1  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 537 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 		 594 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  34.75 
 
 		 533 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  41.9 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 		 543 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  23.75 
 
 		 798 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  39.37 
 
 		 445 aa  89  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  34.75 
 
 		 533 aa  88.6  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 459 aa  89  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 		 623 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1687  OmpA/MotB domain protein  44.33 
 
 		 314 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0605  OmpA/MotB domain protein  33.49 
 
 		 248 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.44 
 
 		 542 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  39.6 
 
 		 330 aa  87.8  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  40 
 
 		 1987 aa  87.4  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 		 544 aa  87  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 498 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  37.84 
 
 		 1793 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 		 296 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 286 aa  87  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 727 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  39.62 
 
 		 321 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 205 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  39.81 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 189 aa  85.1  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>