More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0861 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 401 aa  816    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  33.16 
 
 		 417 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  34.3 
 
 		 406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  31.22 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  30.36 
 
 		 414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  29.9 
 
 		 416 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  30.22 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  34.94 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 		 394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  32.99 
 
 		 408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  32.45 
 
 		 407 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.83 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  30.24 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  27.96 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  33.84 
 
 		 386 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.18 
 
 		 406 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.18 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.2 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  29.6 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  32.94 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  26.34 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.87 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  32.02 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1502  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  28.39 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.39 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.92 
 
 		 387 aa  117  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3748  Extracellular ligand-binding receptor  28.82 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0792  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1092  Extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 		 434 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 		 379 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.57 
 
 		 374 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  27 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.06 
 
 		 382 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  27.06 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.7 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 383 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 		 383 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.13 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.71 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.72 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  29.54 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  35.09 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.27 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.71 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  25.71 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  25.71 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  25.71 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.71 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  25.71 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  25.71 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.19 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 		 379 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 439 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  32 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  27.31 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  29.73 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3400  extracellular ligand-binding receptor  26 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 379 aa  99.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>