123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5262 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
144 aa  300  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 
145 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  42.96 
 
 
329 aa  140  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  46.43 
 
 
148 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  40.56 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  46.72 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 
165 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 
165 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 
165 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  39.44 
 
 
335 aa  130  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  38.73 
 
 
159 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
154 aa  129  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
154 aa  129  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  46.72 
 
 
148 aa  129  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
154 aa  129  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  44.78 
 
 
160 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  41.26 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  39.62 
 
 
167 aa  125  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  44.03 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 
332 aa  124  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  38.73 
 
 
334 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  44.03 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  44.03 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  40.43 
 
 
150 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  45.83 
 
 
141 aa  121  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 
173 aa  120  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  38.96 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  39.1 
 
 
167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  44.63 
 
 
295 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  39.57 
 
 
152 aa  116  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  44.27 
 
 
301 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  43.8 
 
 
319 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 
304 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  37.21 
 
 
163 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  37.21 
 
 
163 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  35.48 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  30.71 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  30.71 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  31.11 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
233 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  30.28 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  26.98 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  26.98 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  28 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  30.94 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  27.13 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  27.78 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  29.91 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  26.4 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  28.38 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  33.06 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  32.23 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  30.3 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
158 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  29.13 
 
 
180 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  28.21 
 
 
188 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  33.01 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  27.14 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  29.13 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  31.3 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  29.13 
 
 
175 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  26.5 
 
 
169 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  30.71 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  26.27 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  29.13 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  29.13 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  29.13 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  25.45 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  29.41 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  24.09 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>