99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1258 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 442 aa  907    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  51.82 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  53.22 
 
 		 434 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  52.23 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  50.45 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3646  twin-arginine translocation pathway signal  47.19 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17089  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2892  extracellular solute-binding protein  48.77 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3960  extracellular solute-binding protein family 1  46.41 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  45.27 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  46.83 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2097  twin-arginine translocation pathway signal  45.68 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.380982  hitchhiker  0.00612544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3322  twin-arginine translocation pathway signal  45.45 
 
 		 441 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  47.06 
 
 		 440 aa  362  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  43.89 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0011  twin-arginine translocation pathway signal  24.88 
 
 		 464 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6832  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.71 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0145789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3119  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.46 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1206  twin-arginine translocation pathway signal  26.23 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1661  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 486 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3313  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3227  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1393  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2546  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2928  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1243  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  24.59 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2910  twin-arginine translocation pathway signal  23.99 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0986419  normal  0.0603659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  32.88 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4117  ABC transporter substrate-binding protein, periplasmic component  23.25 
 
 		 446 aa  67  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16072  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.66 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3529  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00601615  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3687  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 461 aa  63.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.69 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4188  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  24.16 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.16 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.16 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.18 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0306  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  21.11 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.83 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 455 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  20.05 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.44 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25.1 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0255  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 438 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  20.94 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  20.69 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1748  extracellular solute-binding protein  21.65 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  20.55 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.01 
 
 		 422 aa  46.6  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 522 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.01 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7201  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  21.08 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  20.69 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.09 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  22.33 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  20.89 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  25.49 
 
 		 464 aa  43.9  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  45.45 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.04 
 
 		 423 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>