More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1788 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  42.78 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  33.51 
 
 		 217 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  33.51 
 
 		 217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  36.89 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  36.68 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  34 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  35.79 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  35.98 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02846  thymidylate kinase  37.37 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  30.73 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  40.26 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  32.81 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  35.82 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  40.99 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  32.23 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  32.18 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  36.08 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  37.59 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  34.95 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  36.65 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  36.05 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  41.61 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  35.33 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  32.8 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  32.18 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  36.18 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  36.63 
 
 		 196 aa  101  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  35.83 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  37.65 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  30.58 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  33.51 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  34.16 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  30.77 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  30.54 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  30.58 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  34.78 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  36.89 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  31.86 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  31.68 
 
 		 218 aa  98.6  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  29.25 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  30.2 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  35.4 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  41.96 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  39.41 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  32.49 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  39.04 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  32.06 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  31.82 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  35.86 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  31.37 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  31.86 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  35.8 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  32.56 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  36.16 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  41.14 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  37.04 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  34.78 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  30.1 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  33.82 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  32.79 
 
 		 219 aa  95.5  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  31.98 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  34.34 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  33.54 
 
 		 254 aa  95.9  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  35.26 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  31.5 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  34.59 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  31.12 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  31.22 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  36.2 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  34.76 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  35.26 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  35.33 
 
 		 199 aa  95.1  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  36.88 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  33.86 
 
 		 193 aa  94.7  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  31.78 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  30.24 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  32.66 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  30.1 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  29.7 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  35.62 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  35 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0547  thymidylate kinase  39.37 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  32.5 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  35.5 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  31.71 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  29.7 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  33.14 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  36.54 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  33.33 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  34.72 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>