More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0300 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  51.31 
 
 		 193 aa  181  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  49.01 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  47.85 
 
 		 205 aa  178  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  48.96 
 
 		 196 aa  173  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  36.82 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  36.6 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  35.79 
 
 		 203 aa  111  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  34.01 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  33.83 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  37.77 
 
 		 671 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  36.7 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  35.05 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  35.32 
 
 		 901 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  35.29 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  36.73 
 
 		 705 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  35.23 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  36.73 
 
 		 703 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  40.46 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  40.46 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  39.69 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  31.68 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  37.93 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  32.86 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  39.86 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  34.3 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  36.76 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  31.07 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  38.39 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  35.96 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  32.83 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  32.66 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  32.99 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  34.93 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  32.66 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  34.55 
 
 		 254 aa  99  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  35.26 
 
 		 203 aa  97.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  36.61 
 
 		 688 aa  97.8  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  33.66 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  35.52 
 
 		 686 aa  97.1  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  33.66 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  38.32 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  32.11 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  32.11 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  31.79 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  33.66 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  39.86 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  37.67 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  35.5 
 
 		 281 aa  95.9  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  34.52 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  32.02 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  33.84 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  35.75 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  32.66 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  34.21 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  32.5 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  33.96 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  32.83 
 
 		 219 aa  95.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  35.96 
 
 		 197 aa  95.1  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  38.36 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  34.13 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  36.76 
 
 		 662 aa  94  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 686 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  34.02 
 
 		 707 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  31.5 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  32.84 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  33 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  33.51 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0547  thymidylate kinase  32.38 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  32.99 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  32.67 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  36.56 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1625  thymidylate kinase  37.25 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  32.65 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  39.85 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  31.31 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  34.85 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  33.33 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  31.31 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  32.81 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  35.84 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  33.66 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  33.67 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  31.84 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  31.31 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  32.8 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  30 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  28.57 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  34.85 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  31.12 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  31.86 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>