More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0547 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0547  thymidylate kinase  100 
 
 
199 aa  406  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  47.09 
 
 
212 aa  148  6e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.93 
 
 
206 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  41.67 
 
 
217 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  41.67 
 
 
217 aa  135  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  47.89 
 
 
217 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  41.28 
 
 
228 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  39.61 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  40.78 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  38.19 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  39.61 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  39 
 
 
203 aa  129  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  40.91 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  40.44 
 
 
223 aa  128  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  38.28 
 
 
219 aa  128  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  40.51 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  40 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  36.46 
 
 
221 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  39.01 
 
 
208 aa  125  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  38.34 
 
 
260 aa  124  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  37.77 
 
 
214 aa  124  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  42.78 
 
 
208 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  41.28 
 
 
215 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  40.11 
 
 
202 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  34.15 
 
 
217 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  40.91 
 
 
216 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  35.45 
 
 
226 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  39.11 
 
 
215 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  38.31 
 
 
202 aa  121  5e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  39.25 
 
 
212 aa  121  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  35.18 
 
 
205 aa  121  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  44.23 
 
 
217 aa  121  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  36.67 
 
 
211 aa  121  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  36.27 
 
 
210 aa  121  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  36.07 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  40.76 
 
 
233 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  41.24 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  37.31 
 
 
225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  46.97 
 
 
217 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  35.89 
 
 
215 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  38.83 
 
 
207 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  38.12 
 
 
207 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  46.97 
 
 
217 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  45.8 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  36.41 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  35.98 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  41.14 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  36.23 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  35.41 
 
 
213 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2858  thymidylate kinase  39.02 
 
 
220 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  38.67 
 
 
217 aa  118  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  36.98 
 
 
210 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  35.71 
 
 
214 aa  117  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  39.75 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  40 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  47.73 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  39.22 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  35 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  40.67 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  39.78 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  36.71 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  33.5 
 
 
671 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  33.5 
 
 
206 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  30.85 
 
 
213 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  36.41 
 
 
204 aa  115  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  40.56 
 
 
210 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  38.71 
 
 
197 aa  115  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  38.29 
 
 
207 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  34.46 
 
 
203 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  36.36 
 
 
225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  44.7 
 
 
688 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  39.2 
 
 
207 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  37.57 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  34.16 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  43.51 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  39.18 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  35.11 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  37.56 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  35.86 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  34 
 
 
686 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  45.45 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  43.18 
 
 
226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  37.79 
 
 
214 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  38.07 
 
 
215 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  35.96 
 
 
213 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  46.21 
 
 
226 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  38.71 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  42.42 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  36.41 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  40.34 
 
 
210 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  34.95 
 
 
211 aa  111  5e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  39.33 
 
 
219 aa  112  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  32.84 
 
 
209 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  35.64 
 
 
211 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  45.11 
 
 
244 aa  111  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  37.36 
 
 
219 aa  111  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  41.24 
 
 
212 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  43.18 
 
 
225 aa  111  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  38.17 
 
 
199 aa  111  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  38.07 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>