More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_26491 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  100 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  67.31 
 
 		 209 aa  281  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  63.59 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  54.25 
 
 		 215 aa  244  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  50 
 
 		 210 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 211 aa  228  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 211 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  50.77 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  54.75 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  48.89 
 
 		 209 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.5 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  50 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  37.8 
 
 		 203 aa  154  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.63 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  43.96 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  47.28 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  50.83 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  39.39 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  45.71 
 
 		 686 aa  148  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.08 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  43.26 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  37.27 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  35.27 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  42.59 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  46.41 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  46.93 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  37.44 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  42.42 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  41.51 
 
 		 707 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  45.25 
 
 		 234 aa  141  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 901 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  34.78 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  36.57 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  36.41 
 
 		 204 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  41.38 
 
 		 203 aa  138  7.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  37.61 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.95 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  41.51 
 
 		 705 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.59 
 
 		 688 aa  135  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  46.67 
 
 		 703 aa  135  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  36.57 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  42.08 
 
 		 217 aa  134  7.000000000000001e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  40.49 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  37.78 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  43.23 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  36.15 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  46.45 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  41.21 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 671 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 202 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  42.18 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  41.43 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  39.13 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  39.13 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  41.63 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  47.67 
 
 		 686 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  37.31 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  40.11 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  38.86 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  37.1 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  44.38 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 210 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  44.69 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  39.72 
 
 		 212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  39.52 
 
 		 206 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  39.18 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  38.14 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  39.32 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  44.71 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  37.09 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  38.65 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  40.47 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  39.32 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  41.9 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  43 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  37.91 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  41.59 
 
 		 224 aa  124  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  41.3 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  42.78 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  38.17 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  41.3 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  41.99 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>