More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_01581 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  85.24 
 
 		 212 aa  362  3e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  84.29 
 
 		 212 aa  361  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  83.81 
 
 		 212 aa  356  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  54.76 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  50 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  49.02 
 
 		 209 aa  228  4e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  52.86 
 
 		 211 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  52.86 
 
 		 211 aa  214  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  38.73 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 211 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.8 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  40.38 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  36.82 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  40.38 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  37.68 
 
 		 209 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 686 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  44.79 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 901 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  38.31 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  35.07 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  41.95 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  39.15 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  40.2 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  38.42 
 
 		 707 aa  143  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  36.95 
 
 		 216 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  37.38 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  37.68 
 
 		 688 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  39.62 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  37.09 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  35.15 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  37.2 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  38.54 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  38.16 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  37.38 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  38.74 
 
 		 234 aa  141  9e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  38.54 
 
 		 671 aa  141  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  38.83 
 
 		 206 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  36.15 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  38.35 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  38.05 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  44 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  38.35 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  36.87 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  36.32 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  38.53 
 
 		 233 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  42.16 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  33.82 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  38.35 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  39.25 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  37.86 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  37.69 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  37.86 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  37.86 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  38.57 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  43.43 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  37.44 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  40 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  36.41 
 
 		 212 aa  137  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  36.41 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  37.25 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  34.48 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  36.6 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  36.97 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  35.58 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  36.62 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  43.26 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  38.28 
 
 		 686 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  36.49 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 260 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  37.5 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  38.57 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  35.94 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  35.75 
 
 		 205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  36.57 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  35.58 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  37.06 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  35.58 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  35.78 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  38.07 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  34.74 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  36.54 
 
 		 225 aa  131  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  38.62 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  36.26 
 
 		 232 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 205 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0431  thymidylate kinase  36.23 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.19831  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  35.78 
 
 		 206 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>