More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1673 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  100 
 
 
201 aa  412  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  63.55 
 
 
205 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  47.72 
 
 
198 aa  191  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  46.46 
 
 
199 aa  190  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  48.02 
 
 
205 aa  189  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  48.51 
 
 
199 aa  188  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  45.13 
 
 
206 aa  184  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  45.31 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  45.73 
 
 
202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  46.07 
 
 
206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  48.86 
 
 
205 aa  176  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  49.44 
 
 
197 aa  171  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  42.78 
 
 
198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  37.95 
 
 
197 aa  137  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  36.06 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  38.79 
 
 
218 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  36.32 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  34.91 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  34.15 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  32.69 
 
 
210 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  34.43 
 
 
223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  38.5 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  36.19 
 
 
205 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  38.76 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  34.83 
 
 
210 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  36.15 
 
 
214 aa  115  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  32.21 
 
 
210 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  34.63 
 
 
205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  34.45 
 
 
671 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  33.96 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  36.46 
 
 
901 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  36.79 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  33.65 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  33.64 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  31.58 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  35.68 
 
 
205 aa  112  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  31.86 
 
 
207 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  36.67 
 
 
217 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  36 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  35.92 
 
 
208 aa  111  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  32.69 
 
 
211 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  35.07 
 
 
225 aa  111  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  34.76 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  37.63 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  36.02 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  36.45 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  32.86 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  32.86 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  35.38 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  34.47 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  35.61 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  31.1 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  34.9 
 
 
688 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  35.61 
 
 
200 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  32.06 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  33.49 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  32.7 
 
 
243 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  33.49 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  31.88 
 
 
705 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  31.25 
 
 
210 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  33.17 
 
 
206 aa  108  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  30.33 
 
 
210 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  34.48 
 
 
204 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  35.78 
 
 
216 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  32.85 
 
 
214 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  31.73 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  36.22 
 
 
197 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  31.73 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  31.73 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  34.12 
 
 
234 aa  107  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  32.52 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  30.62 
 
 
206 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  30.62 
 
 
206 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  30.62 
 
 
206 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  30.62 
 
 
206 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  30.62 
 
 
206 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  35.82 
 
 
203 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  33 
 
 
215 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  32.23 
 
 
210 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  34.3 
 
 
230 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  30.14 
 
 
206 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  31.66 
 
 
210 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  30.14 
 
 
206 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  34.11 
 
 
207 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  33.95 
 
 
209 aa  106  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  32.37 
 
 
703 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  33.49 
 
 
213 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  36.32 
 
 
193 aa  106  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  32.87 
 
 
217 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  36.32 
 
 
211 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  34.17 
 
 
204 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  35.55 
 
 
224 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  35.86 
 
 
216 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  31.25 
 
 
206 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  33.5 
 
 
203 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  31.28 
 
 
686 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  34.16 
 
 
254 aa  105  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  35.89 
 
 
208 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  32.84 
 
 
281 aa  105  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  31.25 
 
 
206 aa  104  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>