More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0156 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  100 
 
 		 196 aa  385  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  76.68 
 
 		 205 aa  301  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  75.26 
 
 		 204 aa  298  3e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  72.49 
 
 		 193 aa  280  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  48.96 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.44 
 
 		 703 aa  141  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  40.78 
 
 		 705 aa  137  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  41.03 
 
 		 189 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  36.27 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  40 
 
 		 224 aa  120  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  37.31 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  36 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 901 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  36.15 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  36.68 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  40.64 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  39.39 
 
 		 688 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  40.64 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  36.18 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  36.79 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  39.29 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  35.75 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  34.95 
 
 		 214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  38.46 
 
 		 707 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  37.38 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  36.54 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  34.52 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  38.22 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  33.83 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  35.57 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  35.57 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  35.03 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  37.67 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  37.25 
 
 		 211 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  36.55 
 
 		 210 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  35.98 
 
 		 203 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  40.99 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  35.44 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  35.75 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  44.81 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1923  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  36.18 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  36.1 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  36.73 
 
 		 254 aa  108  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2648  thymidylate kinase  32.83 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.106877 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  38.27 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  38.16 
 
 		 217 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  35.44 
 
 		 208 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  32.49 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  36.18 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  37.24 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  35.75 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  36.84 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  36.68 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  35 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  40.62 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  35.44 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  35.44 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  35.44 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  40 
 
 		 662 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  35.44 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  35.44 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  35.44 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  35 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  37.13 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  32.85 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  34.17 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 686 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  34.95 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  34.27 
 
 		 233 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  32.67 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  37.2 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  35.64 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  35.75 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  35.92 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  33.5 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  34.95 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  32.37 
 
 		 217 aa  104  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  36.13 
 
 		 671 aa  104  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  36.11 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  35.18 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  34.54 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  35.68 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  34.85 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  30.69 
 
 		 209 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  32.84 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  34.85 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>