More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1411 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  100 
 
 
198 aa  391  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  74.62 
 
 
199 aa  292  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  69.46 
 
 
205 aa  257  7e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  66.83 
 
 
197 aa  248  6e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  64.32 
 
 
199 aa  227  7e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  47.72 
 
 
201 aa  191  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  48.5 
 
 
205 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  46.24 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  45.08 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  42.27 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  43.33 
 
 
209 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  40.7 
 
 
198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  38.5 
 
 
206 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  36.76 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  34.66 
 
 
212 aa  108  6e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  36.22 
 
 
197 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  34.95 
 
 
208 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  39.42 
 
 
215 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  33.17 
 
 
207 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  32.52 
 
 
207 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  34.95 
 
 
206 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  38.83 
 
 
207 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  38.22 
 
 
211 aa  102  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  33.01 
 
 
208 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  32.16 
 
 
197 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  37.2 
 
 
213 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  35.32 
 
 
205 aa  101  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  40.2 
 
 
208 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  36.95 
 
 
206 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  36.95 
 
 
206 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  36.95 
 
 
206 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  33.5 
 
 
217 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  38.65 
 
 
217 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  37.31 
 
 
202 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  33.88 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  34.78 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  30.77 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  33.5 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  33.17 
 
 
214 aa  99  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  36.87 
 
 
214 aa  98.6  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  33.49 
 
 
211 aa  98.2  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  35.71 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  35.96 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  35.96 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  35.96 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  33.5 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  35.1 
 
 
205 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  34.62 
 
 
205 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  35.58 
 
 
218 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  33.97 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  38.85 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  36.36 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  34.18 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  34.72 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  34.93 
 
 
215 aa  95.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  37.38 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  35.47 
 
 
206 aa  94.7  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  35.44 
 
 
243 aa  94.4  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  37.89 
 
 
901 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  36.11 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  35.35 
 
 
200 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  37.26 
 
 
224 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  36.04 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  31.68 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  32.35 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  36.45 
 
 
210 aa  92.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  33.16 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  33.99 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  32.04 
 
 
210 aa  92  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  33.33 
 
 
671 aa  92  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  34.95 
 
 
205 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  32.51 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  32.51 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  33.04 
 
 
234 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  35.12 
 
 
203 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  32.51 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  32.51 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  32.51 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  37.25 
 
 
281 aa  92  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  33.52 
 
 
202 aa  91.7  6e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  33.51 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  34 
 
 
206 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  32.12 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  32.64 
 
 
215 aa  91.7  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  32.51 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  32.51 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  32.32 
 
 
204 aa  91.3  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  37.8 
 
 
208 aa  91.3  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  33.81 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  34.26 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  37.62 
 
 
217 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  33.33 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  37.43 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  37.31 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  33.16 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  32.97 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  31.86 
 
 
210 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  37.31 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  35.14 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  33.16 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>