More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0144 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  100 
 
 
204 aa  397  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  78.82 
 
 
205 aa  333  7e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  75.26 
 
 
196 aa  298  4e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  71.66 
 
 
193 aa  279  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  49.01 
 
 
205 aa  180  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  41.15 
 
 
189 aa  129  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  44.61 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  42.02 
 
 
218 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  38.6 
 
 
224 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  38.61 
 
 
205 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  38.27 
 
 
196 aa  122  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  45.45 
 
 
205 aa  121  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  41.49 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  41.49 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  40.61 
 
 
198 aa  118  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  36.79 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  35.61 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  38.12 
 
 
217 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  38.12 
 
 
217 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  36.32 
 
 
207 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  40.31 
 
 
232 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  36.82 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  40.2 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  39 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  37.31 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  37.31 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  33.17 
 
 
234 aa  112  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  35.29 
 
 
214 aa  111  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  37.95 
 
 
224 aa  111  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  37 
 
 
215 aa  111  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  38.46 
 
 
705 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  32.24 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  35.64 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  32.65 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  34.98 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  35.64 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  38.1 
 
 
901 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  38.07 
 
 
225 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  34.01 
 
 
203 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  38.34 
 
 
244 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  33.5 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  36.45 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  36.04 
 
 
214 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  37.5 
 
 
703 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  33.16 
 
 
200 aa  108  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  41.41 
 
 
662 aa  107  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  35.5 
 
 
212 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  36.79 
 
 
218 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  37.5 
 
 
226 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  32.84 
 
 
212 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  32.81 
 
 
203 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  32.84 
 
 
208 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  36.71 
 
 
212 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  35.98 
 
 
205 aa  106  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  33.98 
 
 
207 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  32.35 
 
 
213 aa  106  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  39.78 
 
 
244 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  37.25 
 
 
197 aa  105  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  33.84 
 
 
197 aa  105  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  38.86 
 
 
240 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  36.84 
 
 
202 aa  105  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  35.12 
 
 
216 aa  105  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  37.76 
 
 
707 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  33.65 
 
 
215 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  34.13 
 
 
215 aa  105  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  38.86 
 
 
205 aa  104  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  35.6 
 
 
202 aa  104  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  36.55 
 
 
236 aa  104  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  35.05 
 
 
201 aa  104  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  34.5 
 
 
207 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  31.71 
 
 
210 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  36.02 
 
 
225 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  37.44 
 
 
197 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  31.84 
 
 
208 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  39.13 
 
 
208 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  36.27 
 
 
210 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  37.26 
 
 
216 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  39.05 
 
 
214 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  38.46 
 
 
197 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  37.95 
 
 
203 aa  102  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  32.99 
 
 
210 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  36.5 
 
 
213 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  33.49 
 
 
222 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  36.89 
 
 
211 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  34.95 
 
 
208 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  34 
 
 
203 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  36.76 
 
 
206 aa  102  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  33.17 
 
 
210 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  34.12 
 
 
202 aa  101  8e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  30.65 
 
 
210 aa  101  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  34.95 
 
 
208 aa  101  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  37 
 
 
281 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  32.34 
 
 
215 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  33.54 
 
 
202 aa  100  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  33.67 
 
 
206 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  34.17 
 
 
206 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  37.25 
 
 
688 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  36.41 
 
 
221 aa  99.8  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  34.47 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  31.86 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>