More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0637 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  100 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  79.7 
 
 
199 aa  309  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  71.96 
 
 
197 aa  259  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  69.46 
 
 
198 aa  257  8e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  63.68 
 
 
199 aa  246  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  48.02 
 
 
201 aa  189  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  47.24 
 
 
205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  43.28 
 
 
202 aa  157  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  45.64 
 
 
198 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  43.56 
 
 
206 aa  143  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  42.49 
 
 
206 aa  132  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  41.92 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  40.22 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  39.02 
 
 
215 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  38.86 
 
 
202 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  38 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  36.32 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  36.68 
 
 
217 aa  108  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  35.71 
 
 
205 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  37.67 
 
 
217 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  35.75 
 
 
208 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  34.18 
 
 
197 aa  103  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  35.78 
 
 
205 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  33.15 
 
 
212 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  35.51 
 
 
217 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  35.58 
 
 
212 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  35.15 
 
 
217 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  38.86 
 
 
217 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  35.5 
 
 
211 aa  102  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  34.55 
 
 
224 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  34.48 
 
 
206 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  34.92 
 
 
197 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  37.5 
 
 
209 aa  102  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  35.1 
 
 
206 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  34.74 
 
 
211 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  38.46 
 
 
206 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  35.91 
 
 
215 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  34.18 
 
 
197 aa  101  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  36.84 
 
 
901 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  34.67 
 
 
203 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  36.77 
 
 
217 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  37.75 
 
 
226 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  34.3 
 
 
219 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  36.5 
 
 
213 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  35.29 
 
 
215 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  37.5 
 
 
207 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  34.27 
 
 
214 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  36.54 
 
 
215 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  37.8 
 
 
206 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  37.8 
 
 
206 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  36 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  36 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  37.8 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  35.89 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  35.21 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  39.23 
 
 
206 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2519  thymidylate kinase  35.19 
 
 
225 aa  99  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  hitchhiker  0.00330244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  39.23 
 
 
206 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  30.73 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  39.23 
 
 
206 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  34.5 
 
 
211 aa  99  5e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  34.33 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  33.65 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  39.42 
 
 
203 aa  98.2  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  33 
 
 
204 aa  98.2  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  36.75 
 
 
196 aa  98.2  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  33.96 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  29.05 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  35.78 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  36.02 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  34.42 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  36.98 
 
 
671 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  33.49 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  32.7 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  35.55 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  33.18 
 
 
212 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  31.22 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  38.1 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  34.6 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  31.94 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  35.03 
 
 
226 aa  95.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  34.88 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  36.22 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  36.11 
 
 
214 aa  94.7  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  28.57 
 
 
212 aa  94.7  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  35.94 
 
 
206 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  38.73 
 
 
200 aa  94.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  34.26 
 
 
220 aa  94  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  33.02 
 
 
203 aa  94  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  31.65 
 
 
213 aa  94  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  37.8 
 
 
205 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  33.03 
 
 
226 aa  94  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  35.12 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  30.66 
 
 
213 aa  94  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  32.59 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  37.06 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  31.96 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  36.36 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  32.11 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  36.36 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>