More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0456 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  100 
 
 
197 aa  401  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  37.95 
 
 
201 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  37.91 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  38.74 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  41.44 
 
 
205 aa  125  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  37.76 
 
 
206 aa  122  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  37.86 
 
 
707 aa  121  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  36.89 
 
 
703 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  41.58 
 
 
686 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  37.76 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  36.82 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  37.13 
 
 
705 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  34.91 
 
 
211 aa  115  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  36.68 
 
 
196 aa  116  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  36.73 
 
 
198 aa  115  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  37.81 
 
 
193 aa  114  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  36.27 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  34.34 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  34.74 
 
 
215 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  35.47 
 
 
225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  34.88 
 
 
224 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  36.41 
 
 
205 aa  106  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  35.47 
 
 
216 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  33.5 
 
 
213 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  37.25 
 
 
204 aa  105  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  33.98 
 
 
210 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  36.55 
 
 
189 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  36.27 
 
 
200 aa  103  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  34.18 
 
 
205 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  34.13 
 
 
688 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  37.2 
 
 
686 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  34.6 
 
 
217 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  37.5 
 
 
202 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  33.17 
 
 
901 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  34.67 
 
 
197 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  36.02 
 
 
212 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  33.16 
 
 
202 aa  102  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  33.18 
 
 
213 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  32.16 
 
 
198 aa  102  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  34 
 
 
206 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  36.59 
 
 
202 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  37.14 
 
 
688 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  34.31 
 
 
214 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  33.5 
 
 
207 aa  101  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  37.81 
 
 
671 aa  101  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  34.3 
 
 
196 aa  101  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  38.12 
 
 
217 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  31.73 
 
 
215 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  34.3 
 
 
219 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  32.51 
 
 
224 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  33.67 
 
 
199 aa  99.8  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  33.33 
 
 
232 aa  99  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  32.85 
 
 
662 aa  99  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  32.87 
 
 
216 aa  98.6  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  34.63 
 
 
281 aa  98.6  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  31.22 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  31.22 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  31.22 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  33.17 
 
 
197 aa  98.6  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  31.68 
 
 
197 aa  98.2  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  33.33 
 
 
208 aa  98.2  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  34.31 
 
 
205 aa  97.8  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  30.73 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  37.19 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  30.73 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  30.73 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  34.47 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  30.73 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  30.73 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  31.66 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  34.17 
 
 
197 aa  95.9  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  31.22 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  32.2 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  33.5 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  34.34 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  30.24 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  32.34 
 
 
205 aa  95.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  33.65 
 
 
221 aa  95.1  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  34.01 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  31.02 
 
 
211 aa  94.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  32.06 
 
 
215 aa  94.7  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  31.71 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  31.71 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  30.56 
 
 
214 aa  94  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  31.71 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  31.71 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  31.71 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  31.22 
 
 
206 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  31.48 
 
 
219 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  31.71 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  31.71 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  32.51 
 
 
218 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  33.5 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  34.22 
 
 
196 aa  92.4  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  33.33 
 
 
222 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0547  thymidylate kinase  32.02 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  33.78 
 
 
233 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  33.01 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  33.17 
 
 
214 aa  92  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  32.83 
 
 
217 aa  92  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>