More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2036 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  100 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  50 
 
 		 189 aa  186  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  36.82 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  34.83 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  39.18 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  34.85 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  32.64 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  34.48 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  34.22 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  34.36 
 
 		 254 aa  92  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  34.33 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  33.16 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  32.16 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  32.54 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  32.95 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  34.47 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  34.47 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  34.47 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  34.47 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  34.47 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  34.47 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  33.97 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  32.29 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  34.47 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  33.98 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  34.76 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  35.12 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  32.43 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  34.5 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  32.35 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  32.81 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  33.66 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  32.16 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  34.11 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0823  thymidylate kinase  33.52 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.142499  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  32.31 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  34.52 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  34.36 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  31.58 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  33.71 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  31.34 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  32.67 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  32.86 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1625  thymidylate kinase  34.27 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1250  dTMP kinase  29.61 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  33.92 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1281  thymidylate kinase  29.13 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  30.05 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 686 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  31.94 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  31.98 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  32.67 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  34.05 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  32.11 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  31.44 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  37.66 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  35.48 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  36.78 
 
 		 662 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  32.98 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  29.86 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  31.44 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  35.14 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0559  thymidylate kinase  33.15 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  26.76 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  28.5 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  28.71 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  31.71 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  30.19 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  31.02 
 
 		 688 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  34.78 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  32.06 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  33.86 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  35.98 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  33.85 
 
 		 686 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  34.42 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  32.65 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  32.85 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  32.09 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  35.09 
 
 		 707 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  29.78 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1707  thymidylate kinase  33.52 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0493685 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  31.89 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  30.59 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  33.66 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  29.58 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0020  thymidylate kinase  31.84 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  32.43 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  27.96 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  31.94 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  28.8 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  34.42 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  34.42 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  30.99 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  27.41 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>