More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5864 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  100 
 
 		 210 aa  413  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  48.7 
 
 		 218 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  49.47 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  49.47 
 
 		 219 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2080  dTMP kinase  46.83 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174265  normal  0.0165952 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  38.79 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  37.42 
 
 		 198 aa  121  9e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  41.92 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  34.01 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  36.55 
 
 		 196 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  40.91 
 
 		 686 aa  111  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  38.54 
 
 		 686 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  38.55 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  36.27 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0559  thymidylate kinase  38.55 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1625  thymidylate kinase  37.95 
 
 		 199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  36.18 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  47.83 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  36.23 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  33.81 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  37.44 
 
 		 688 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  36.53 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  33.64 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  37 
 
 		 901 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  35.07 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  37.76 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  37.32 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  37.02 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  38.86 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 688 aa  99.8  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2599  thymidylate kinase  35.23 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  39.29 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  32.55 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  40.85 
 
 		 232 aa  98.6  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  32.32 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  32.06 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  40.27 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  40.27 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  40.27 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  40.27 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  38.97 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  40.27 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  40.27 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  40.94 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  34.6 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  40.27 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  33.64 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  31.9 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  35.61 
 
 		 671 aa  95.5  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1250  dTMP kinase  28.71 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  39.86 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  39.01 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  40.5 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  39.86 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  34.6 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  30.23 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  40.14 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  33.82 
 
 		 203 aa  95.1  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1281  thymidylate kinase  28.71 
 
 		 207 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  40.14 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  40.14 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  40.14 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  36.36 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  37.21 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  29.95 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  34.51 
 
 		 233 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  32.16 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  30.88 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  37.68 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  30 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  36.49 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  34.17 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  29.47 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  35.07 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  33.33 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  34.13 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  33.81 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  39.19 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  35.16 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  34.66 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  41.13 
 
 		 237 aa  92.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  32.23 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  30.09 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  35.88 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>