More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2599 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2599  thymidylate kinase  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  30.54 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  37.07 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  36.02 
 
 		 198 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1250  dTMP kinase  33.65 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1281  thymidylate kinase  33.18 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0823  thymidylate kinase  36.19 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.142499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  34.3 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  36.13 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  38.73 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  38.15 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  35.23 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0559  thymidylate kinase  34.74 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  34.48 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1625  thymidylate kinase  35.07 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  34.6 
 
 		 199 aa  98.6  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  38.41 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  39.02 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2080  dTMP kinase  32.08 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174265  normal  0.0165952 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  31.53 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  32.86 
 
 		 200 aa  88.6  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  36.2 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04630  thymidylate kinase, putative  28.08 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  30.43 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  30.43 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  34.09 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  29.76 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  30.95 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  34.09 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  30.13 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  30.05 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  29.63 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  29.25 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  31.55 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  29.61 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  33.65 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  28.36 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  32.38 
 
 		 688 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  35.14 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  30.48 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  31.28 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  31.55 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  29.19 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  35.37 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  29.56 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  30.35 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  28.1 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  35.81 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  30.65 
 
 		 901 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  30.66 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  32.8 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  27.83 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  35.14 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  29.15 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  29.48 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  28.64 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  27.44 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  29.22 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  29.58 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  28.31 
 
 		 730 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  31 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  30.92 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  27.94 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  30.48 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  30.95 
 
 		 686 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  27.45 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  29.61 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  29.03 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  29.72 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  31.18 
 
 		 703 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  30 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  28.5 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  30.33 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  30.59 
 
 		 705 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1098  thymidylate kinase  31.73 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.456966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  28.41 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  26.21 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  30.29 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  31.47 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  27.67 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  27.96 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  31.49 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  26.78 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  31.82 
 
 		 686 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  39.64 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  27.32 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  29.08 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  28.41 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  32.02 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  28.71 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  29.38 
 
 		 671 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0020  thymidylate kinase  28.97 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  31.02 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  28.44 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  30.25 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  30.32 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  34.5 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  29.91 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  33.11 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  28.31 
 
 		 688 aa  69.3  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>