More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0725 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0725  dTMP kinase  100 
 
 
207 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1281  thymidylate kinase  61.35 
 
 
207 aa  274  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1250  dTMP kinase  60.87 
 
 
207 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  33.65 
 
 
210 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  36.63 
 
 
196 aa  112  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  35.71 
 
 
189 aa  95.5  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2216  dTMP kinase  31.91 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2126  dTMP kinase  31.91 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.454256  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2599  thymidylate kinase  35.1 
 
 
209 aa  91.7  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0823  thymidylate kinase  32.83 
 
 
202 aa  91.3  8e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.142499  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1884  dTMP kinase  28.5 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  34.33 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  34.5 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1721  thymidylate kinase  32.92 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  35.52 
 
 
203 aa  87  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  31.58 
 
 
197 aa  85.5  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  29.8 
 
 
254 aa  85.5  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5864  thymidylate kinase  28.99 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.851432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  31.28 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0559  thymidylate kinase  34.68 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  31.55 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2080  dTMP kinase  25.35 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174265  normal  0.0165952 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  30.73 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  31.25 
 
 
197 aa  79  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  32.14 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  29.68 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  32.04 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  32.21 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  29.61 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  29.81 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  27.27 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  33.71 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  32.91 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  29.81 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  30.73 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1625  thymidylate kinase  33.15 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  31.36 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  33.12 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  25.37 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  32.03 
 
 
730 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  24.27 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  33.33 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  31.12 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  29.3 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  25.37 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  27.32 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  36 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  28.71 
 
 
233 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  26.7 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf161  thymidylate kinase  30.14 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.403235  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0128  dTMP kinase  28.57 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000012015  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  30.18 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  30.52 
 
 
688 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  28.72 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  27.01 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  25 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  27.7 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  23.72 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  30.41 
 
 
707 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  26.94 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  26.58 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  31.82 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  27.01 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  27.7 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  28.64 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  25.62 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  26.92 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  27.44 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  28.99 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  26.51 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  27.32 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  28.57 
 
 
223 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  24.41 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  27.87 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0980  thymidylate kinase / thymidylate synthase  29.9 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.653916  normal  0.0681105 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  27.85 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  27.44 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  27.44 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  27.44 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  27.44 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  28.84 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0636  thymidylate kinase  30.3 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  27.44 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  27.44 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  25.71 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  26.98 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  24.54 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  29.38 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  26.67 
 
 
220 aa  62  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  29.81 
 
 
205 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  29.8 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  23.7 
 
 
211 aa  61.6  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  30.36 
 
 
234 aa  61.6  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  25.37 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  27.23 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  26.7 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  31.03 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  27.31 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  29.61 
 
 
901 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  24.3 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>