More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2629 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  100 
 
 
206 aa  420  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  55.61 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  58.12 
 
 
205 aa  221  9e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  54.64 
 
 
209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  55.96 
 
 
198 aa  216  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  46.07 
 
 
201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  43.62 
 
 
205 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  44.92 
 
 
199 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  42.27 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  41.27 
 
 
197 aa  135  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  42.49 
 
 
205 aa  132  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  37.91 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  43.68 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  35.92 
 
 
202 aa  124  7e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  38.97 
 
 
705 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  36.89 
 
 
216 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  38.02 
 
 
707 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  37.7 
 
 
218 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  38.97 
 
 
703 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  36.18 
 
 
211 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  35.33 
 
 
196 aa  103  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  34.55 
 
 
212 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  39.69 
 
 
202 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  32.51 
 
 
204 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  37.95 
 
 
205 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  36.27 
 
 
213 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  39.38 
 
 
688 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  35.03 
 
 
196 aa  101  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  34.74 
 
 
213 aa  101  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  35.18 
 
 
214 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2036  thymidylate kinase  39.18 
 
 
196 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54882  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  35.15 
 
 
234 aa  100  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  36.98 
 
 
688 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  31.36 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  36.32 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  32.99 
 
 
211 aa  98.2  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  36.79 
 
 
210 aa  98.2  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  37.82 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  34.34 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  37.82 
 
 
662 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  33.96 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  34.87 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  32.37 
 
 
217 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  34.36 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  33.84 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  32.37 
 
 
217 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  35.57 
 
 
686 aa  96.3  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  35.23 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  34.83 
 
 
686 aa  95.9  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  34.16 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  36.65 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  33.33 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  33.33 
 
 
234 aa  95.5  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  34.76 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  34.87 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  34.52 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  37.95 
 
 
224 aa  94.7  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  34.57 
 
 
211 aa  94.7  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  33.02 
 
 
215 aa  94.7  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  34.57 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  32.82 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  34.88 
 
 
243 aa  94  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  35.53 
 
 
219 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  35.29 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  34.43 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  35.03 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  34.87 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  33.18 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  35.83 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  35.68 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  34.5 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  35.68 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  33.15 
 
 
202 aa  92.8  4e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  36.41 
 
 
216 aa  92.8  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  33.17 
 
 
215 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  34.5 
 
 
208 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  34.5 
 
 
208 aa  92  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  34.5 
 
 
208 aa  92  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  34.5 
 
 
208 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  34.5 
 
 
208 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  31.25 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  35.84 
 
 
205 aa  92  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  36.13 
 
 
206 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  34.5 
 
 
208 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  35.29 
 
 
254 aa  91.3  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  35.11 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  32.29 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  35.2 
 
 
226 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  38.75 
 
 
217 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  35 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  33.51 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  34.12 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  34.44 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  32.49 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  34.94 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  35.08 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  32.37 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  34.39 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  34.5 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  34.18 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>