More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1888 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  71.96 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  67.51 
 
 		 199 aa  249  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  66.83 
 
 		 198 aa  248  6e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  62.69 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  49.44 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  43 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  41.87 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  45.74 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  41.27 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  42.33 
 
 		 202 aa  134  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  43.41 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  35.92 
 
 		 211 aa  107  8.000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  37.76 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  34.95 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  33.84 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  34.12 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  35.68 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  33.52 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  34.83 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  33.82 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  33.33 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  34.6 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 217 aa  98.6  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1948  thymidylate kinase  33.03 
 
 		 260 aa  98.6  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  31.68 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  35.27 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  32.64 
 
 		 211 aa  97.8  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  32.47 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  33.16 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  34.3 
 
 		 207 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  34.6 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  32.52 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  34.8 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  32.52 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  36.81 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  33.82 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  35.5 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  36.2 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  34.8 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  33.98 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  34.93 
 
 		 210 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  38.07 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  33.96 
 
 		 210 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  35.55 
 
 		 208 aa  94.4  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  33.98 
 
 		 206 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  33.98 
 
 		 206 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  33.98 
 
 		 206 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  34.95 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  33.86 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  31.88 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  34 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  35.29 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  35.71 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  35.38 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  31.86 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  34.7 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  35.27 
 
 		 214 aa  91.7  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  33.65 
 
 		 225 aa  91.7  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  31.88 
 
 		 211 aa  91.7  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  32.23 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  32.54 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  35.47 
 
 		 211 aa  91.3  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  34.31 
 
 		 225 aa  91.3  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf161  thymidylate kinase  33.96 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.403235  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  36.19 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  33.18 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  32.68 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  32.85 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  34.26 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  34.98 
 
 		 901 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  31.4 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  34.26 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  33.98 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  34.31 
 
 		 281 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  32.7 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  32.58 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  34.15 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  33.02 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  34.83 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  30.93 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  32.04 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>