More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1298 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  74.62 
 
 		 198 aa  292  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  63.68 
 
 		 205 aa  246  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  62.69 
 
 		 197 aa  242  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  57.5 
 
 		 199 aa  224  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  50 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  49.2 
 
 		 205 aa  157  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  45.86 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  44.92 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  41.58 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  43.15 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  37.24 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  35.78 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  36.27 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  34.15 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  39.39 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  35.41 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  30.65 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2255  thymidylate kinase  33.82 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  38.81 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  36.82 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  32.06 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  37.91 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  29.95 
 
 		 206 aa  98.2  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  31.37 
 
 		 203 aa  98.2  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  37.79 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  32.7 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  29.81 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  31.58 
 
 		 211 aa  97.1  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  32.86 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  36.92 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 210 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  36.92 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  34 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  34.17 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  33.96 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  37.07 
 
 		 213 aa  95.9  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  33.03 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  34.93 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  38.73 
 
 		 281 aa  95.5  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  34.67 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  37.32 
 
 		 243 aa  94.7  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  33.66 
 
 		 220 aa  94.7  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  32.18 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  33.67 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  34.11 
 
 		 671 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  35.68 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf161  thymidylate kinase  32.49 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.403235  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  31.96 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  34.13 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  32.66 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  32.5 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  34.62 
 
 		 703 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  34.95 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  31.12 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  37.56 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  31.55 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  34.78 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  34.95 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  29.8 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  34.16 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  31.09 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  34.65 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  31.71 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  32.66 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  32.38 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  33.18 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  32.54 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  33.18 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  33.18 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  33.16 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  31 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  35.05 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  30.7 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  28.16 
 
 		 212 aa  91.3  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  34.13 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  34.93 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 217 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  30.77 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  33.5 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  32.89 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  32.02 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  33.65 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  33.8 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  34.47 
 
 		 686 aa  89.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  32.57 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  36.49 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  34.45 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  33.17 
 
 		 707 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  35.12 
 
 		 224 aa  89.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  29.91 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  34.27 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3388  thymidylate kinase  36.48 
 
 		 228 aa  89.4  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159825  normal  0.0629111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>