More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1098 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1098  thymidylate kinase  100 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1673  thymidylate kinase  63.55 
 
 		 201 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1298  thymidylate kinase  50 
 
 		 199 aa  194  9e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  48.5 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0637  thymidylate kinase  47.24 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2627  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 199 aa  181  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  45.85 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1334  thymidylate kinase  46.91 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.648721  normal  0.0540228 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2629  thymidylate kinase  43.62 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1719  thymidylate kinase  45.25 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2063  thymidylate kinase  41.09 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1571  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1888  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.526884 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  40.4 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  40.95 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  42.51 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  38.73 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  38.61 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  37.04 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  37.04 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 205 aa  121  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  39.23 
 
 		 688 aa  121  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  39.79 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  37.76 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  38.54 
 
 		 707 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  39.13 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  41.03 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  35.27 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  41.54 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  39.8 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  39.7 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  37.85 
 
 		 688 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  36.23 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  35.07 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  34.95 
 
 		 220 aa  115  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  37.44 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  35.58 
 
 		 686 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  36.54 
 
 		 671 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  35.55 
 
 		 705 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  37.2 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  39.34 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  35.05 
 
 		 217 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  36.68 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  36.84 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40.21 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  40 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  38.73 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  36.23 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  34.5 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  38.73 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  34.16 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  35.38 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  39.17 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  38.12 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  38.12 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  38.12 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  36.54 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  39.09 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  37.81 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  34.88 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  35.68 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  34.6 
 
 		 703 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  34.15 
 
 		 707 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  34.91 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  36.95 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  34.45 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  33.97 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  35.71 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  35.38 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  35.94 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  34.7 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  35.38 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  38.5 
 
 		 686 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  37.13 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  36.45 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  34.4 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  36.65 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  37.13 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  37.13 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  33.18 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  36.95 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  36.95 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  37.93 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  36.79 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  33.5 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  33.18 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  38.07 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  38.01 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  33.18 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  34.29 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  33.17 
 
 		 234 aa  107  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>